Strukturen til dobbeltstrenget DNA er universell i alle levende celler, men forskjeller forekommer i metodene for å ekstrahere genomisk DNA fra dyre- og planteceller. Selv om genomisk DNA lever i kjernen av celler, avhenger mengden og renheten av ekstrahert DNA av cellens type og størrelse. For eksempel inneholder visse celler mer DNA og urenheter enn andre. Les videre for å lære mer om DNA-ekstraksjonsforskjeller.
Generell DNA-ekstraksjon
Hvis du behandler plante- og dyreceller med et såpevann, vil det nedbryte lipidene i cellen og kjernemembranene. Deretter vil DNA-blandingen skille seg fra cellemembranene og proteinene. Deretter kan du bruke alkohol for å utfelle DNA i løsningen. Avhengig av mengden i prøven, kan DNA være synlig med det blotte øye. Husk imidlertid at denne enkle prosedyren ikke nødvendigvis produserer DNA med høy renhet.
Plante- og dyreceller
Planteceller skiller seg fra dyreceller på grunn av deres stive cellevegg og organeller som kloroplast. De inneholder også proteiner og enzymer som spiller en rolle i fotosyntese. Noen planteceller har polyploidi, noe som betyr at de har mer enn en kopi av hvert kromosom per celle. I tillegg produserer cellulære prosesser som forekommer i planter som fotosyntese en rekke sekundære metabolitter. Dyreceller har ikke en cellevegg, men trenger fortsatt kjemikalier som natriumdodecylsulfat (SDS) for å forstyrre cellemembranen for å frigjøre genomisk DNA.
Plante-DNA-ekstraksjon
Plantegenomisk DNA er vanskeligere å utvinne på grunn av plantens cellevegg. Du kan fjerne det ved homogenisering eller ved å tilsette cellulase for å nedbryte cellulosen som utgjør celleveggen. I tillegg kan metabolittene som er tilstede i plantecellen forstyrre genomisk DNA-ekstraksjon ved å forurense DNA-prøven under nedbørsprosessen.
Animal DNA-ekstraksjon
Perifere blodleukocytter er den viktigste kilden til genomisk DNA fra dyr, men prøveinnsamling er vanskelig fordi blodet må komme direkte fra dyret. Blod inneholder en rekke forbindelser som proteiner, lipider, hvite blodlegemer, røde blodlegemer, blodplater og plasma, som kan forurense DNA-prøven. Imidlertid er den primære forurensningen av animalsk DNA ekstrahert fra blodprøver hem, som er ikke-proteinkomponenten i hemoglobin.
DNA-forskjellene
Forskjellene mellom plante- og dyr-DNA ligger i rekkefølgen av baser i spiralen. Forbindelser som finnes i planteceller er fraværende i dyreceller, og DNA-basesekvenser gjenspeiler dette. Dessuten er det genomiske plante-DNA ofte større enn animalsk DNA. Disse forskjellene påvirker også ekstraksjonsmetoder, utbytte og renhet av DNA.
