Taksonomer klassifiserer alt liv på jorden i ett av fem riker. Medlemmer av de fire første kongedømmene, Animalia, Plantae, Fungi og Protista, er alle eukaryote organismer. Dette betyr at cellene i organismen, som kan være encellede eller flercellede, har genetisk materiale i en kjerne. Det femte riket, Monera, inneholder alle encellede organismer som ikke har en ekte kjerne. Medlemmer av riket Monera blir ofte referert til som bakterier.
Eubacteriophyta
Eubacteriophyta er de sanne grampositive bakteriene. Grampositiv betyr at disse bakteriene vil gi et positivt resultat i en Grams flekk. Grampositive bakterier har et høyere peptidoglykaninnhold enn gramnegative bakterier, mens gramnegative bakterier har en høyere lipidkonsentrasjon. Innenfor dette fylket kan bakterier være sfæriske (coccus), stavformede (bacillus) eller korketrekker (spirillum).
Cyanophyta
Denne bakteriefylen inneholder organismer som en gang var kjent som "blågrønne alger." I dag er de generelt klassifisert som cyanobakterier, da fraværet av en kjerne tydelig indikerer at de er nærmere knyttet til de andre bakteriene enn de er til alger. Men i likhet med alger inneholder cyanobakterier klorofyll og er i stand til å fotosyntetisere. Noen forskere spekulerer i at cyanobakteriene er forløperne til kloroplaster i høyere fotosyntetiserende organismer, som alger og planter.
Proteobakterier
Proteobacteria er den mest varierte fylmen i Monera-riket, og inneholder nitrogenfikserende bakterier, som gjør nitrogen fra luften tilgjengelig for planter og dyr. Uten dem kunne ikke livet som vi kjenner det eksistere. Proteobakterier inkluderer også den kjente E. coli og salmonella arter av bakterier, kjent for å være potensielle midler for matforgiftning.
Spirochaetes
Disse bakteriene har en spiralform, som navnet antyder. Treponema pallidum, en bakterie i denne fylmen, forårsaker syfilis hos mennesker. Borrelia burgdorferi, et annet medlem av denne gruppen, forårsaker borreliose. Ikke alle spiroketter er skadelige for vertene sine. Noen av dem lever i fordøyelsessporene til termitter der de sammen med andre mikroorganismer bidrar til termittens evne til å fordøye cellulose. Dette er gunstig, i det minste for termitten.
Klassifisering
Det er verdt å merke seg at det er forskjellige tankeskoler angående klassifisering av organismer. Det er ingen "offisiell" taksonomi for Monera i spesifikk phyla. Faktisk abonnerer mange forskere på et system som gjør opp hele riket Monera, og andre fire riker også, og erstatter dette med et system der alt liv er delt inn i tre domener. To av disse ville inneholde organismer som tidligere var medlemmer av Monera, mens alt annet liv ville være en del av det tredje domenet.