Neutrofile og acidofile heterotrofiske bakterier utgjør de fleste bakterieartene. Uttrykkene "nøytrofile" og "acidofile" refererer til bakterieartenes optimale pH-nivå - et mål på et stoffs surhet eller basalitet. For eksempel måler eddik som surt, og natron som base. PH-skalaen varierer fra 0 til 14, med 7, pH i rent vann, midt i midten.
Neutrofile heterotrofer
Flertallet av bakterier, nøytrofile, lever i jord eller vann og vokser best ved en nøytral pH mellom 6 og 8. Hvis pH varierer for langt utenfor dette området, kan ikke nøytrofile bakterier overleve. De fleste bakterier som forårsaker sykdommer hos mennesker er også nøytrofile heterotrofer, godt egnet til å overleve i en menneskekropp.
Acidophilic Heterotrophs
Acidofile bakterier vokser bedre ved lavere pH-nivåer, vanligvis under en pH på 6, ettersom de har biologiske mekanismer som gjør det mulig for dem å holde sin indre pH nær nøytral. Syremynedrenering - den forurensede, svært sure avrenningen fra gruveområdene - inneholder en høy populasjon av acidofiler som oksyderer sulfidet som finnes i metallmalmer. I følge Science Education Resource Center ved Carleton College utviste acidophile Ferroplasma som ble funnet i drenering av syrer, pH-nivåer så lave som null.
Obligatorisk acidofile heterotrofer
Obligate acidophiles krever lav pH, under 4 eller 5, for å overleve. Cellemembranen til obligatoriske acidophiler oppløses faktisk ved nøytrale pH-nivåer og forårsaker celledød. Mange obligatoriske acidofiler er også termofiler - organismer som vokser best ved høye temperaturer - og ofte funnet i vulkanske jordarter. Thiobacillus ferrooxidans er trolig rangert som den hyppigst studerte jernoksiderende acidofile bakterien.
