Prosessen med å produsere protein fra en DNA - deoksyribonukleinsyre - sekvens inkluderer to hovedtrinn: transkripsjon og translasjon. Under transkripsjon opprettes en messenger ribonukleinsyre, eller mRNA, fra DNA-malen. Dette mRNA kombineres med et ribosomalt RNA, kjent som rRNA, og overførings-RNA, eller tRNA, kompleks for å oversette mRNA-koden til en aminosyresekvens, et protein. DNA består av en sekvens av nukleotidbaser. De fire basene er adenin, tymin, guanin og cytosin. Sekvensen der disse basene forekommer på en streng av DNA koder til slutt for produksjon av visse proteiner. Etter at cellen har produsert proteinene, kan de brukes strukturelt eller i forskjellige metabolske prosesser.
Lag et mRNA-transkripsjon av DNA-sekvensen. Hver base i DNA samsvarer med en annen base. Bilder av DNA viser det vanligvis i en dobbel helix, med basene på den ene tråden som kobles via bindinger til de komplementære basene på den motsatte strengen. Komplementære baser er: adenin (A) og tymin (T), og cytosin (C) og guanin (G). Så hvis en DNA-streng leser A-C-G-C-T-A, er den komplementære strengen T-G-C-G-A-T. Du kan finne sekvensen til mRNA-transkripsjonen på samme måte ved å bruke komplementene til basene vist i DNA-sekvensen. RNA inneholder imidlertid ikke basetymin (T); i stedet erstattes denne basen med uracil (U). Når du kommer over et adenin (A) i DNA-sekvensen, må du matche det med en uracil (U).
Hvis DNA-sekvensen er A-A-T-C-G-C-T-T-A-C-G-A, er mRNA-sekvensen U-U-A-G-C-G-A-A-U-G-C-U.
Lag en tRNA anti-kodonsekvens fra mRNA-transkripsjonen. Hver tRNA har et sett med tre baser på det kjent som et anti-kodon. Antikodonet samsvarer med komplementære baser i mRNA-sekvensen. For å bestemme den totale anti-kodonsekvensen som vil matche en streng av mRNA, transkriberer du bare RNA-sekvensen; med andre ord, skriv ut de utfyllende basene. Ved å bruke den tidligere nevnte mRNA-sekvensen er tRNA-anti-kodonsekvensen A-A-T-C-G-C-U-U-A-C-G-A.
Bryt tRNA-sekvensen du fant i tre-basesett. Fordi anti-kodoner består av tre baser om gangen, er AAT-CGC-UUA-CGA en bedre måte å skrive anti-kodonsekvensen A-A-T-C-G-C-U-U-A-C-G-A på.
Tips
-
Du kan finne antikodonsekvensen enda raskere ved å skrive DNA-sekvensen ved å bruke U for uracil i stedet for T for tymin. Del deretter sekvensen i de tre base-antikodonene.
Du kan bruke antikodonsekvensen for å matche proteinene som blir tilsatt av hvert tRNA under translasjon, og skape en aminosyresekvens. Kontroller imidlertid at referansediagrammet for aminosyrer du bruker er for antikodoner, (se Ressurser). Mange aminosyresekvenseringskart viser bare de matchende mRNA-kodonene i stedet for tRNA-antikodonene, slik at du kan hoppe over trinnet med å bestemme antikodonsekvensen.
Sekvensen til tRNA-molekylet er ganske enkelt en RNA-transkripsjon av DNA-sekvensen som ble brukt til å lage den.