Selv om de dype, mørke omgivelsene i huler virker som de aldri kunne støtte plantelivet, trives visse typer flora i det miljøet. Grotter har en tendens til å være fuktige og ha konstant temperatur, en økologi som er ideell for planter som sopp, mose og alger. Planter kan til og med vokse i de elektriske lysene som mennesker tar med seg for å utforske hulene.
Grottesoner
Grotter er delt inn i tre soner: inngang, skumring og mørkt. Inngangssonen har fortsatt rikelig med lys for å støtte mange typer planter som trær og gress. I skumringssonen er noe lys i stand til å trenge gjennom, men det er ikke nok til å støtte de fleste typer planteliv. Imidlertid er noen planter i stand til å overleve i denne sonen, for eksempel mosser og bregner. Den mørke sonen har ikke noe naturlig lys og kan bare støtte de mest hardføre plantene som sopp og alger.
Planter i Twilight Zone
Når lysmengden avtar, reduseres også plantelivets størrelse og kompleksitet. Så mens det kan vokse blomstrende planter i inngangssonen, er skumringssonen vanligvis preget av mose og bregner. Planter som bor i denne regionen av hulen har utviklet tilpasninger som gjør at de kan leve under slike dårlige lysforhold. En slik tilpasning er at deres kloroplaster, de sollysfangende molekylene i en plante, alle samles på kanten av cellen som er nærmest lyskilden.
Planter i den mørke sonen
Selv om det nesten ikke er noe lys i den mørke sonen, kan planter fortsatt vokse. Spesielt er sopp dyktig til å bo på disse mørke stedene. Sopp trives spesielt godt fordi hulene er fulle av næringsrike flaggermusguano, en perfekt jord for sopp. Alger kan også leve i de mørkeste delene av hulene. I stedet for å bruke fotosyntese, kan disse alger bruke en annen metabolsk vei for å produsere sin energi.
Lampenflora
Planter kan også vokse i huler utstyrt med elektriske lys. Disse plantene, kjent som lampenflora, har en tendens til å være mindre levende i fargen og noe vansiret. Lampenflora er vanligvis moser, bregner og alger. I huler som lyses opp konstant av lamper, kan disse invasive plantene forårsake problemer med hulens naturlige struktur eller annen forhistorisk veggkunst. På grunn av deres skadelige natur blir lampenflora vanligvis kontrollert gjennom fysiske, kjemiske og biologiske metoder.