Chromosomale crossover, ook wel genetische crossover genoemd, is een normaal proces waarbij genen recombineren. De recombinatie verhoogt de genetische variatie door te recombineren om verschillende eigenschappen te produceren.
TL; DR (te lang; niet gelezen)
Geninterferentie is een maat voor de onafhankelijkheid van crossovers van elkaar. Als een crossover in een regio een crossover in een andere regio beïnvloedt, wordt die interactie interferentie genoemd. Interferentie = 1 − c.o.c., waarbij c.o.c. is de coïncidentiecoëfficiënt (c.o.c.)
Mensen hebben 23 chromosomen. Tijdens meiose deelt één cel zich twee keer om vier dochtercellen te vormen. Deze vier dochtercellen hebben de helft van het aantal chromosomen van de oudercel. Ze kunnen dan samenkomen met een andere chromosomale helft van het ei of het sperma om een heel paar te worden.
Soms blijven deze twee delen niet bij elkaar. Als de stukken breken, kunnen ze zich aansluiten bij een ander gebroken stuk. De twee genetische kopieën die recombineren worden chromatiden genoemd. Problemen zoals het syndroom van Down of andere genetische aandoeningen kunnen ontstaan wanneer genen verkeerd worden gecombineerd.
De meeste cross-overs komen normaal voor. Af en toe treedt er een dubbele cross-over op. Dit is wanneer de chromatiden op twee punten samenkomen in plaats van één. Bij het tweede contactpunt kunnen de chromatiden weer scheiden en weer genetische informatie uitwisselen.
Geninterferentie is een maat voor de onafhankelijkheid van crossovers van elkaar. Met andere woorden, aangezien u weet dat dubbele cross-overs voorkomen, moet u de vraag beantwoorden of cross-overs in aangrenzende chromosoomgebieden onafhankelijk zijn of niet. Als ze niet onafhankelijk zijn, betekent dit dat een cross-over in een regio de waarschijnlijkheid van een cross-over in een aangrenzende regio beïnvloedt. Als een crossover in een regio een crossover in een andere regio beïnvloedt, wordt die interactie interferentie genoemd.
Interferentie berekenen
Bij het overwegen hoe interferentie moet worden berekend, is de eerste stap het berekenen van de coïncidentiecoëfficiënt (c.o.c.). De c.o.c. hangt op zijn beurt af van de waarschijnlijkheid van een dubbele crossover, de zogenaamde crossover-frequentiewaarde, ook bekend als de "frequentie van dubbele recombinanten".
De coïncidentiecoëfficiënt is de verhouding van de waargenomen tot verwachte dubbele recombinanten.
Coëfficiënt van coïncidentie = frequentie waargenomen dubbele recombinanten / verwachte frequentie dubbele recombinanten
Het verwachte aantal dubbele recombinanten in een monster van twee onafhankelijke regio's is gelijk aan het product van de recombinante frequenties in de aangrenzende regio's.
Interferentie wordt dan als volgt gedefinieerd:
interferentie = 1 − c.o.c.
Interferentie vertelt je hoe sterk een cross-over in een van de DNA-regio's interfereert met de vorming van een cross-over in de andere regio.
Als de interferentie nul is, betekent dit dat de dubbele crossovers plaatsvinden zoals voorspeld en dat een crossover in een regio onafhankelijk plaatsvindt van een crossover in een aangrenzende regio.
Als de interferentie 1 is, betekent dit dat de interferentie volledig is en dat er geen dubbele crossovers zijn waargenomen omdat een crossover in een regio de kans op een crossover in een aangrenzende regio elimineert regio.
Doorgaans vertonen uw gegevens een interferentie tussen 0 en 1. Waarden hoger dan nul maar lager dan één geven aan dat er interferentie optreedt.