Naaldbomen hebben twee soorten kegels: de pollenkegel en de zaadkegel. Sommige coniferen hebben beide kegeltypes aan dezelfde boom, waardoor de boom zichzelf kan bestuiven. Kruisbestuiving vindt plaats wanneer een boom alleen zaadkegels produceert en daarom moet worden bevrucht door stuifmeel dat naar de zaadkegels drijft van stuifmeelkegels die zich op andere nabijgelegen bomen bevinden.
Pollenkegels zijn kenmerkend kleiner en breder dan zaadkegels. Stuifmeelkegels hebben de neiging om te verdwalen en te sterven zodra het stuifmeel in de kegels is vrijgegeven om de zaadkegels te bevruchten. In de rustfase kan een coniferenknop mannelijk, vrouwelijk of vegetatief zijn. Onderscheid maken tussen knoptypes in dit stadium is alleen mogelijk door dissectie. Een aanwijzing die kan helpen bij de identificatie van pollenkegels, is de locatie. Zaadkegels hebben de neiging zich hoger in de boom te ontwikkelen om te helpen bij de verspreiding zodra de zaden zijn bestoven.
Zaadkegels worden vaak gebruikt om het boomtype te identificeren, omdat ze langere tijd op of onder de boom blijven. De slanke zaadkegelknoppen zwellen vier tot zes weken totdat de rode of groen getipte eierschalen beginnen te verschijnen. De schubben hebben de neiging om rechtop te vouwen vanaf de kegelbasis en vervolgens naar beneden te hangen nadat ze het stuifmeel van de stuifmeelkegels hebben geaccepteerd om de zaadontwikkeling te initiëren en de rijpheid van de kegel te signaleren.
Sommige coniferen hebben geen stuifmeel of zaadkegels. In plaats daarvan produceert de boom fruit dat de zaden gedeeltelijk bedekt. De Canadese taxus is een voorbeeld van een naaldboom producerende conifeer die een vlezige bedekking bevat om de zaden van de boom te bevatten. Om overmatig zaadverlies te voorkomen door roofdieren van dieren en vogels die zich willen voeden met de vrucht van de taxus, deze boom heeft zich aangepast zodat de vrucht giftig is en de zaden overblijven ongestoord.
Kegeldragende coniferen, of pinophyta, worden geclassificeerd als gymnospermen (naakt gezaaid) omdat hun eitjes en zaden niet zijn ingesloten in eierstokken of worden aangetroffen in beschermende fruitbedekkingen. Als een conifeer zowel stuifmeel als zaadkegels aan dezelfde boom heeft, wordt deze verder geclassificeerd als een diploïde sporofyt. Zodra de zaden zijn gevormd nadat de bestuiving heeft plaatsgevonden, gaan de schubben van de kegel open om de zaden vrij te geven voor verspreiding door water, wind en de beweging van mens en dier.