Het mariene ecosysteem staat onder zware druk; in veel gebieden zijn de omstandigheden die nodig zijn om het leven in stand te houden, in gevaar of niet aanwezig. De vernietiging van mariene habitats komt vooral voor langs kusten waar de menselijke populaties zijn toegenomen. Habitatverlies, vervuiling, overbevissing, destructieve visserijpraktijken en opwarming van de aarde ondermijnen allemaal het mariene milieu.
Kustlijnen
Habitatverlies, vervuiling, afvoer en verhoogd zoutgehalte vernietigen koraalriffen, zeegrassen en andere habitats voor vogels en vissen. Omdat wetlands aan de kust worden opgevuld om de groeiende menselijke populaties te huisvesten, vermindert de afdamming van rivieren de stroom van zoet water, vertraagt het afvloeien van voedingsstoffen en remt het de vismigratie. Minder zoet water betekent een hoger zoutgehalte in wetlands en estuaria, wat schadelijk is voor de grassen die het water zuiveren terwijl het naar de zee stroomt. Erosie veroorzaakt door ontbossing stuurt slib in rivieren, beken en uiteindelijk de oceaan, waardoor het zonlicht wordt geblokkeerd dat nodig is voor koraalriffen om te overleven.
overbevissing
De maximale duurzame opbrengst wordt berekend door visserijbiologen om de hoeveelheid vis te schatten die van een populatie kan worden geoogst zonder de levensvatbaarheid op lange termijn in gevaar te brengen. Tussen 1974 en 1999 verdrievoudigde het aandeel visserijen dat de maximale duurzame opbrengst voor kabeljauw overtrof, van 10 procent naar 30 procent. Volgens het Center for Ocean Solutions is de totale vangst sinds het begin van de jaren negentig in een van 's werelds meest productieve visserij, de Zee van Okhotsk, is tussen twee en twee en een half keer afgenomen als gevolg van: overbevissing. In de Stille Oceaan beheert meer dan de helft van de eilandstaten hun koraalriffen niet duurzaam.
zeebodem
Gebruikmakend van een praktijk die bekend staat als bodemtrawls, slepen commerciële vissersvaartuigen grote netten die aan zware gewichten zijn bevestigd over de zeebodem. Beoogde soorten zijn garnalen, kabeljauw, tong en bot, maar alles langs de zeebodem wordt gevangen. Bodemtrawlvisserij kan het mariene ecosysteem permanent beschadigen en de bijvangst (niet-doelsoorten zoals zeeschildpadden, zeevogels en zoogdieren) worden gewoon overboord gegooid. Bijvangst kan 90% van de totale vangst bedragen en vaak worden bedreigde vissen en diepzeekoralen gedood.
verzuring
Naarmate het klimaat warmer wordt, neemt de oceaan meer koolstofdioxide op, waardoor het zuurder wordt. Verhoogde zuurgraad remt het vermogen van mariene organismen om schelpen te ontwikkelen, en dit omvat de kleine dieren genaamd plankton die de basis vormen van het voedselweb van de oceaan. Sommige onderzoekers suggereren dat dit er ook voor zal zorgen dat sommige mariene soorten minder zwavelverbindingen uitstoten die wolkenvorming bevorderen, waardoor de aarde afkoelt. Klimaatmodellen voorspellen dat dit in deze eeuw voor 0,5 graad Celsius (0,28 graden Fahrenheit) extra opwarming zal zorgen.