Het leven is tot bloei gekomen in de Costa Ricaanse regenwouden en in het mariene milieu (één op de 20 van alle plant- en diersoorten komt voor in Costa Rica) Rica), maar er zijn ook meer dan 100 soorten op de International Union for the Conservation of Nature and Natural Resources bedreigde soorten lijst. Ontbossing, habitatconversie en vervuiling zijn de boosdoeners achter de verzwakking van veel soorten.
Zoogdieren
Costa Rica heeft een van de rijkste populaties vleermuizen ter wereld, bestaande uit de helft van de zoogdierpopulatie. Vleermuissoorten op de lijst variëren van de grote roofzuchtige spectrale vleermuis tot de Hondurese witte vleermuis, slechts ongeveer 37 tot 47 mm lang, hoewel beide een laag risico vormen. Katachtigen zoals de kleine gevlekte kat, Costa Ricaanse poema en Midden-Amerikaanse jaguar zijn verjaagd uit hun... habitats, en cottontop tamarin, mantled brulaap en Geoffroy's spinaap primaten zijn sterk verminderd. Andere bedreigde zoogdieren zijn de reuzenmiereneter, Sambar-herten en Baird's tapir.
Vogels
Costa Rica is de thuisbasis van 894 vogelsoorten, meer dan in de VS en Canada samen. Hiervan zijn er meer dan 600 permanente bewoners, waaronder de bedreigde naakthalsparapluvogel, zwarte guan en blauw-en-gouden tanager, maar vogels zoals de cerulean grasmus en elegante stern trekken. De Cocos-eilandvink leeft op het Cocos-eiland 360 mijl voor de kust van Costa Rica. Het is de enige van Darwins vinken die niet volledig endemisch is voor de Galápagos. Andere bedreigde vogels zijn bekende soorten zoals de adelaar (zwarte solitaire adelaar), ara (grote groene ara), kolibrie (mangrovekolibrie) en papegaai (roodvoorhoofdpapegaai).
Reptielen en amfibieën
De vijfkielige stekelstaartleguaan en de modderschildpad met smalle brug zijn enkele van de bedreigde reptielen, maar er zijn er nog veel meer bedreigde amfibieën, waarvan de meeste kikkers of salamanders zijn die typisch worden vertegenwoordigd door een grote diversiteit in regenwoud omgevingen. De maki-bladkikker en Starrett's treefrog worden vermeld als ernstig bedreigd. Dat geldt ook voor de El Empalme-wormsalamander en twee soorten padden: de pico blanco pad en de pass-stubfoot pad. De gouden pad van Monte Verde is sinds 1989 niet meer gezien en wordt als uitgestorven beschouwd.
Vis
De meeste Costa Ricaanse vissen op de lijst met bedreigde diersoorten zijn bijna bedreigd of kwetsbaar. Deze omvatten de olijftandbaars, het Pacifische zeepaardje en de kroonhaai. Een aantal roggen staat ook op de lijst, zoals de bullseye elektrische rog in de Stille Oceaan en de cownose rog in de Atlantische Oceaan.
ongewervelde dieren
Er zijn een aantal bedreigde schaduwdamsels, insecten die op libellen lijken. Deze omvatten soorten met zwarte rug, langwerpige, chiriquita, cacao en reventazon. Veel van de andere bedreigde insecten zijn knobbelstaartlibellen zoals de limon, humped, catago, vulkaan, alajuela en gehoornde soorten. Twee soorten zoetwaterkrabben en verschillende zeekoralen kwamen ook op de IUCN-lijst.
Planten
Er zijn meer dan 9.000 bekende plantensoorten in Costa Rica. Bedreigde planten omvatten leden van de peulvruchtenfamilie zoals abarema en de lancepod, waarvan de laatste zijn naam ontleent aan zijn lansachtige vrucht. Er zijn ook 24 soorten van de bloeiende plant eugenia, negen soorten van de aromatische plant quararibea en twee soorten van het geslacht virola, dat nauw verwant is aan de nootmuskaat en gele bloemen heeft met een scherpe geur. Andere belangrijke bedreigde geslachten zijn de koraalbes, de waaierpalm cryosophila en de groenblijvende of droge loofboom cedrela. De Costa Ricaanse jatropha, manilkara-boom en gavilán blanco-boom zijn specifiek bedreigde plantensoorten.