Maak een grafiek van de productconcentratie tegen de tijd voor de gegevens van de eerste reageerbuis van de enzymatische test. Opmerking: de horizontale as moet 'tijd' zijn en de verticale as moet 'productconcentratie' zijn.
Bereken de lineaire regressielijn voor de gegevenspunten die u in sectie 1, stap 1 hebt uitgezet. Hoewel Excel en grafische rekenmachines dit lineaire model gemakkelijk kunnen bepalen, kunt u een schatting van de regressie afleiden helling van de lijn door het verschil in productconcentratie tussen aangrenzende gegevenspunten te delen door hun verschil in tijd.
Noteer de helling van de lineaire regressielijn uit sectie 1, stap 2 als "initiële reactiesnelheid (Vo)". Opmerking: in het regressielijnmodel "[productconcentratie] = m [tijd] + b", is de coëfficiënt "m" de helling.
Herhaal stap 1, 2 en 3 voor de rest van de reageerbuisjes in de test.
Plot het omgekeerde van de substraatconcentratie voor elke reageerbuis versus het omgekeerde van de initiële reactiesnelheid (uit sectie 1, stap 4). Als bijvoorbeeld de beginsnelheid voor een reageerbuis met een initiële substraatconcentratie van 50 micromolmo (uM) was 80 uM/s, de inverse zou 1/50 uM zijn voor de substraatconcentratie en 1/80 uM/s voor de initiële snelheid. Opmerking: de inverse substraatconcentratie moet op de horizontale as liggen en de inverse beginsnelheid moet op de verticale as liggen.
Opmerking: de substraatconcentratie moet op de horizontale as liggen en de initiële reactiesnelheid moet op de verticale as liggen.
Bepaal de lineaire regressielijn voor de grafiek die u in sectie 2, stap 1 hebt uitgezet. Opmerking: omdat u het y-snijpunt voor de regressielijn moet weten, moet u de punten van Sectie 2, Stap 1 in Excel of een grafische rekenmachine en gebruik de ingebouwde regressiemodellering functionaliteit.
Deel 1 door de y-snijding van de lineaire regressielijn. Dit geeft je de waarde van de inverse van Vmax, de maximale reactiesnelheid voor het enzym. Opmerking: als het lineaire regressiemodel de vorm aanneemt "[Inverse Vo] = m [Inverse Substraat Conc.] + b", dan zou de waarde van "b" het y-snijpunt zijn. Deel 1 door "b" om de inverse van Vmax te berekenen.
Deel 1 door het resultaat uit sectie 2, stap 3 om de werkelijke waarde van Vmax te berekenen.
Bepaal de concentratie van het enzym in de oorspronkelijke test (zie de onbewerkte gegevens). Let op: de enzymconcentratie is voor alle reageerbuisjes gelijk; alleen de substraatconcentraties variëren in de test.
Verdeel de Vmax (uit sectie 2, stap 4) door de enzymconcentratie (uit sectie 2, stap 5). Het resultaat is de waarde van Kcat.
Andy Pasquesi, een in Chicago gevestigde copywriter, heeft uitgebreide ervaring met schrijven voor auto's (BMW, MINI Cooper, Harley-Davidson), financiële diensten (Ivy Funds, William Blair, T. Rowe Price, CME Group), klanten in de gezondheidszorg (Abbott) en consumentengoederen (Sony, Motorola, Knoll). Hij heeft een Bachelor of Arts in het Engels van Harvard University, maar geeft niet om de Oxford-komma.