Mikrobioloģija ir pārāk mazu organismu izpēte, lai tos redzētu bez redzamības. Mikrobioloģiju var iedalīt daudzos dažādos veidos, kā tas ir piemērots tādu organismu izpētei, kas daudz pārsniedz daudzšūnu organismus. Mikrobioloģiju var aplūkot kā dažādu taksonomisko dalījumu izpēti vai sadalīt pa pētāmo organismu grupām. Mikrobioloģiju var uzskatīt arī par dažādu studiju jomu kolekciju, vai arī to var sadalīt, ņemot vērā dažādas aktivitātes, kuras veic mikrobiologi.
Sadalījumi
Biologi visu dzīvi uz Zemes ir klasificējuši vienā no trim milzīgajām taksonomiskām grupām, kuras dēvē par domēniem: arhejām, baktērijām un eukarijām. Arhejas un baktērijas ir prokarioti, organismi, kuru šūnām nav centrālā kodola. Tie visi ir vienšūnas organismi. Baktērijas to ārējā apvalkā parasti izceļas ar atšķirīgu struktūru - šūnu sienu, kas veidota no molekulām, kuras sauc par peptidoglikāniem. Arhejas ir līdzīgas baktērijām, izņemot to, ka to iekšējā bioķīmija darbojas pēc dažādiem noteikumiem, un daudzas no tām ir pielāgotas skarbajai videi. Eukariju raksturo šūnas, kuru šūnās ir kodoli un citas unikālas iekšējās struktūras. Lai gan daudzi eikarioti ir lieli organismi, piemēram, ziloņi, sarkankoku koki un cilvēki, lielākā daļa eikariotu sugu ir vienšūnas mikroorganismi.
Grupas
Vēl viens veids, kā sadalīt mikrobioloģijas pētījumu, ir visu vienšūnu organismu grupas. Tas ignorē organismu taksonomisko līmeni un būtībā uzskata, ka visas vienības, kas atrodas zem noteikta lieluma, ietilpst mikrobioloģijas lietussargā. Tas ietver baktērijas un arhejas, kas ir domēni, un sēnītes, aļģes un vienšūņi, kas ir karaļvalstis eikarijas apgabalā. Tajā ietilpst arī vīrusi, kas nav iekļauti nevienā dzīvo organismu taksonomiskajā klasifikācijā.
Sēnītes ietver veidnes un raugu. Aļģes ir vienšūnas augi, tādi, kas dīķa virsmu padara zaļu vai dzeltenu. Vienšūņi ir kā vienšūnas dzīvnieki - tie parasti ir kustīgāki nekā aļģes vai sēnītes. Vīrusi ir pilnīgi atšķirīga subjektu grupa, kas šķērso robežu starp dzīvu un nedzīvu, taču arī viņu pētījums ietilpst mikrobioloģijas lietussargā.
Disciplīnas
Mikrobioloģiju var klasificēt arī pēc disciplīnām, kas pēta mikrobioloģiju. Piemēram, imunologi pēta cilvēku slimību mehānismus, ko izraisa infekcija no baktērijas, sēnītes, vīrusi vai vienšūņi, savukārt epidemiologi pēta infekciju veidu pārsūtīts. Pārtikas un lauksaimniecības mikrobiologi pēta veidu, kā sēnītes vai baktērijas var izmantot pārtikas ražošanai, kā arī mehānismus, ar kuriem mikroorganismi var sabojāt kultūraugus. Biotehnologi meklē veidus, kā izmantot mikroorganismus, lai ražotu cilvēcei izmantojamus materiālus.
Aktivitātes
Mikrobiologi, veicot mikroskopisko vienību izpēti, veic dažādas darbības, un mikrobioloģiju var arī klasificēt, pamatojoties uz šīm darbībām. Tie ir ērti sakārtoti grupās, ko sauc par sešiem "I". Šos sešus "I" var izteikt kā inokulāciju, inkubāciju, izolēšanu, pārbaudi, izmeklēšanu un identifikāciju. Tie attiecas uz mikroorganismu kultivēšanas, paraugu ņemšanas, novērošanas un testēšanas procesiem.