Mikrobiologi pēta mikroorganismu īpašības piemēram, aļģes, vienšūņi, baktērijas, sēnītes un vīrusi, izmantojot mikroskopu. Lai gan dažus organismus, piemēram, vienšūņus un rauga šūnas, ir viegli novērot, izmantojot mitru stiprinājumu, baktēriju šūnas prasa krāsošanu. Lai labāk vizualizētu baktēriju šūnas un šūnu struktūras, zinātnieki izstrādāja vairākas metodes, piemēram, Grama krāsošanu, skābes noturīgu krāsošanu un fluorescējošu krāsošanu. Izmantojot šādas krāsošanas metodes, ir iespējams noteikt strukturālas iezīmes, kas palīdz klasificēt baktērijas.
Labāka vizualizācija
Baktēriju organismi ir tik mazi, ka lielākā daļa no tiem ir redzami tikai mikroskopā ar a palielināšanas jauda no 1000X. Tomēr tikai izmēra palielināšana nenodrošina pietiekamu skaidrības pakāpi, tāpēc baktērijas pirms novērošanas ir jānotrāso, lai nodrošinātu vizualizēšanai nepieciešamo skaidrību.
Identifikācija un klasifikācija
Baktēriju krāsošana, lai atšķirtu baktēriju tipus, ir pazīstama kā diferenciālā krāsošana. Grama traips ir viens no šādiem diferenciāliem traipiem, kas atšķir baktērijas pēc to šūnu sienas satura. Izmantojot šo metodi, baktēriju šūnas reaģē ar kristālvioletu traipu, lai iegūtu violetu krāsu. Pievienojot krāsošanas līdzekli, dažas baktēriju šūnas zaudē krāsu, bet citas to nedara. Pievienojot safranīna traipu, nokrāsotās šūnas traipu uzņem sarkanā krāsā, bet baktēriju šūnas, kas nezaudēja krāsu, paliek violets. Baktēriju šūnas, kas iegūst sarkano krāsu, sauc par gramnegatīviem organismiem, un tās, kas neuzņem krāsu, klasificē kā gram-pozitīvos organismus. Grama krāsošana nodrošina ātru metodi infekcijās iesaistīto baktēriju sākotnējai identificēšanai. Līdzīgi krāsošanas ar skābi procedūra palīdz īpaši noteikt organismus, kas pieder baktēriju klasei, ko sauc par mikobaktērijām, piemēram, Mycobacterium tuberculosis.
Dzīvotspējas noteikšana
Baktēriju kultūras paraugos bieži ir svarīgi noteikt dzīvo baktēriju šūnu klātbūtni. Krāsošanas metodes, piemēram, fluorescējoša krāsošana, palīdz noteikt, vai kultūras šūnas ir dzīvotspējīgas. Dzīvās baktērijas spēj pārveidot 5-ciān-2,3-ditolil-tetrazolija hlorīda (CTC) traipu krāsā, kurai ir sarkana fluorescence. Tāpēc, kad ar CTC iekrāsotās kultūras izstaro šādu fluorescenci, tas norāda uz dzīvotspējīgu baktēriju klātbūtni. Propīdija jodīds ir traips, kas iedarbojas tikai uz nedzīvām šūnām, kurām ir bojātas membrānas, un tāpēc ir noderīgs, lai identificētu mirušās baktēriju šūnas.
Šūnu struktūru identificēšana
Krāsošana nodrošina metodi, kā skaidri vizualizēt vairākas šūnu struktūras. Piemēram, Fuelgen krāsošanas metode ļauj identificēt kodolu baktēriju šūnās, savukārt Alberta traips ir noderīgs metahromatisko granulu vizualizācijā. Līdzīgi sudraba impregnēšanas tehnika ļauj identificēt spirohetes. Flagella ir viegli novērot, ja to iekrāso ar Ryu traipu. Malahīta zaļā krāsošana palīdz identificēt baktēriju sporas.