Kā aprēķināt peptīdu izoelektrisko punktu

Peptīdi ir īsi polimēru fragmenti, kas sastāv no aminoskābēm. Katram peptīdam ir noteikta aminoskābju secība, kas apzīmēta ar trīs burtu vai viena burta kodu; piemēram, aminoskābe alanīns tiek saīsināts kā “Ala” vai “A.” Peptīdu lādiņš šķīdumā ir atkarīgs no šķīduma skābuma. Izoelektriskais punkts (pI) attiecas uz šķīduma skābuma vērtību, pie kuras peptīda molekulas neto lādiņš ir nulle. Izoelektriskajā punktā peptīda šķīdība ir minimāla. Izmantojiet pieejamos tīmekļa serverus, lai aprēķinātu peptīda aminoskābju secības pI vērtību.

Uzrakstiet peptīdu secību, izmantojot viena burta kodu. Piemēram, ja peptīdam ir aminoskābju secība Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (alanīns - serīns - glumatīnskābe - leicīns - prolīns), tad viena burtu secība ir "ASELP". Vajadzības gadījumā skatiet trīs burtu konversijas tabulu uz vienu burtu, kas sniegta 4 Resursi.

Izmantojiet jebkuru tīmekļa pārlūkprogrammu, Internet Explorer vai Firefox, piemēram, lai pārietu uz serveri, kas aprēķina peptīda izoelektrisko punktu (pI); skatīt resursus.

instagram story viewer

Izlasiet izoelektriskā punkta (pI) vērtību, kas norādīta rindā "Teorētiskā pI / Mw". Mūsu piemērā pI ir 4,00. Ņemiet vērā, ka serveris aprēķina arī peptīda molekulmasu (Mw).

par autoru

Oksana Foksa ir ārštata rakstniece, kuras specializācija ir medicīna un ārstēšana, datoru programmatūra un aparatūra, digitālā fotogrāfija un finanšu pakalpojumi. Viņa absolvējusi Maskavas Medicīnas koledžu 1988. gadā ar formālu apmācību pediatrijā.

Foto kredīti

Comstock Images / Comstock / Getty Images

Teachs.ru
  • Dalīties
instagram viewer