Augu, aļģu un dažādu fitoplanktonu šūnās ir hlorofils. Šī vitāli svarīgā šūnu molekulārā sastāva daļa kontrolē fotosintēzes procesu organismā vai augā. Pētnieki bieži pārbauda hlorofila līmeni virszemes ūdens paraugos no ezeriem, upēm un strautiem, kā arī augu dzīvē. Testa rezultāti norāda pašreizējos apstākļus un barības vielu līmeni, kas ietekmē paraugu.
Hlorofila līmeņa mērīšana palīdz noteikt organisma stāvokli un ūdens kvalitāti. Augsts hlorofila līmenis parasti norāda, ka paraugā ir daudz barības vielu, parasti slāpekļa un fosfora. Nenormāli zems hlorofila līmenis liecinātu par iespējamu piesārņojumu, septiskās sistēmas noplūdi vai noteci šajā apgabalā. Parasti paraugi tiek savākti un salīdzināti laika gaitā, lai izsekotu izmaiņām parauga laukumā.
Spektrofotometrija un augstas veiktspējas šķidruma hromatogrāfija (HPLC) ir divas metodes, ko izmanto, lai mērītu hlorofila daudzumu ūdens paraugā. Ūdens tiek savākts un filtrēts, lai izolētu hlorofilu saturošus organismus. Šo organismu šūnas tiek saplēstas, lai iegūtu hlorofilu. Savākto paraugu ievieto acetona šķīdumā. Paraugu analizē vai nu ar spektrofotometriju, vai ar HPLC metodi. Spektrofotometrija ietver hlorofila absorbcijas vai fluorescējošo īpašību pārbaudi. Paraugu var analizēt arī ar HPLC metodi. Divas laboratorijas testēšanas metodes ir parauga fluorescējošo spēju mērīšana. Paraugus pakļauj noteiktam gaismas viļņa garumam (parasti 663 un 645 nm), kas liek hlorofilam reaģēt, izstarojot lielāku viļņa garumu.
Lai pārbaudītu hlorofila līmeni, parasti dzīvo augu, varat izmantot skaitītāju. Uz parauga virsmas spīd divas LED gaismas, visticamāk, augu lapa. Sarkanās gaismas diodes gaismas maksimālais viļņa garums ir 650 nm, bet infrasarkanais - 940 nm. Daļu gaismas absorbē hlorofils; pārējais tiek absorbēts visā paraugā. Hlorofila proporciju citiem parauga mērījumiem aprēķina skaitītājā un parāda kā patvaļīgu mērvienību starp 0 un 199.