Tāpat kā lielākā daļa biomu uz Zemes, savannas ekosistēma izdzīvo, ievērojot smalku līdzsvaru starp vides faktoriem un dažādām sugām, tostarp cilvēkiem. Smags sausums var laupīt šiem zālājiem dzīvību radošo ūdeni un zaļumus, savukārt malumednieki un pamatiedzīvotāji bieži draud pārtraukt barības tīklu, nogalinot dzīvniekus sportam vai izdzīvošana.
Cilvēka darbība
Cilvēka darbība var nopietni apdraudēt savannu ekosistēmu darbības traucējumus. Ilgtspējīga ūdens izmantošana un apūdeņošana var potenciāli izžūt dzīvinošās upes un ūdens caurumus. Reģionos, kur pamatiedzīvotāji uzturā regulāri iekļauj buhmeat - savvaļas gaļu, pārnadžu populācija ir ievērojami samazinājusies. Daži savannu savvaļas dzīvnieki tiek medīti arī kā trofejas; jo īpaši melnās degunradžas tiek medītas par vērtīgajiem ragiem. Pat dažas augu sugas tiek pārmērīgi novāktas to komerciālās vērtības dēļ. Kokgriezumi, kas izgatavoti no Āfrikas melnkoks, savannas koks, bieži tiek pārdoti tūristu tirgos.
Sausums un smagas ganības
Ilgstošs, smags sausums bīstami ietekmē savannas ekosistēmu, un ganību modeļi šo efektu saasina. Smaga sausuma un ganību kombinācija var mainīt zālāju, kurā galvenokārt ir ēdamas, daudzgadīgas zāles, uz savannu, kurā dominē neēdamas zāles un augi. Viegli ganīti zālāji saglabā savu garšu, daudzgadīgo zālaugu sugu kvalitāti, taču augu sugu sastāvu joprojām varētu mainīt. Eksperti ir pieprasījuši ganību apsaimniekošanas risinājumus sausuma periodu laikā, lai ietekmētu potenciālo izmaiņu virzību uz zālāju ilgtspējību.
Pārtuksnešošanās
Tropiskās savannas bieži robežojas ar sausiem, tuksneša reģioniem, un tuksnesim līdzīgu apstākļu izplatīšanos sausos zālāju rajonos sauc par pārtuksnešošanos. Šis savannas ekosistēmas apdraudējums ietver klimata pārmaiņu, lauksaimniecības prakses, pārganības, agresīva lauksaimniecības apūdeņošana, kas pazemina ūdens līmeņa līmeni prom no augu saknēm, mežu izciršanas un erozija. Katru gadu vairāk nekā 46 000 kvadrātkilometru Āfrikas savannas kļūst par tuksnesi. Sausumam izturīgu augu stādīšana varētu stabilizēt mainīgās smilšu kāpas un sākt papildu veģetācijas izplatīšanos.
Oglekļa emisijas
2012. gada apsekojumā liels koksnes augu masas pieaugums tika saistīts ar “CO2 mēslošanas efektu”. Autori uzskatīja, ka kokaugu augšanas ātruma pieaugumu izraisīja atmosfēras oglekļa palielināšanās dioksīds. Dramatisks koku un krūmu daudzuma pieaugums var apdraudēt visu savannu ekosistēmu, jo šie augi patērē vairāk ūdens nekā zāles. Dabas aizsardzības speciālisti Namībijā ziņoja, ka kokaugi ir kavējuši gan antilopu, gan gepardi, kas viņus medī - attīstība, kurai varētu būt nezināmas sekas visā pasaulē zālāji.