Fermentai yra molekulės, ypač baltymai, kurie padeda paspartinti biochemines reakcijas sąveikaujant su ingredientais (reagentais ir produktais) jų visam laikui nekeičiant. Šis palengvinimo procesas yra žinomas kaip katalizėir atitinkamai patys fermentai yra identifikuojami kaip katalizatoriai.
Fermentai, kaip ir daugelis žaidėjų mikrobiologija gali turėti ilgus ir sudėtingus pavadinimus, beveik visa tai baigiasi „-ase“. Bet jei esate susipažinę su oficialia sistema, kurioje įvardijami fermentai, galite daug ką išnarplioti paslapčių apie tam tikro fermento funkciją, tiksliai nežinant, kokia fermento reakcija katalizuoja.
Kas yra katalizatorius?
Kalbant, katalizatorius yra bet koks subjektas, kuris pagerina tam tikros veiklos srautą, efektyvumą ar efektyvumą. Jei esate krepšinio treneris ir žinote, kad išleidus tam tikrą populiarią žaidėją į žaidimą, sužadinsite minią ir komandą apskritai, tada jūs naudosite katalizatoriaus buvimą.
Žmonių katalizatoriai priverčia viską atsitikti ir jie linkę priversti aplinkinius žmones atrodyti maksimaliai išmanantys. Taip pat dėl biologinių katalizatorių tam tikri biocheminiai procesai gali pasirodyti beveik automatiniai iš tikrųjų šie procesai sukluptų ir sukluptų link neužtikrintos išvados, jei nebūtų fermentas.
Katalizatoriai dažnai nerašomi į cheminės reakcijos, kurioje jis dalyvauja, formulę, nes pagal apibrėžimą katalizatorius reakcijos pabaigoje nepakinta nuo pradinės formos.
Fermentas: apibrėžimas ir atradimas
1870-ųjų pabaigoje buvo nustatyta, kad kažkas iš mielių gali sukelti cukraus šaltinius alkoholiniais gėrimais virsti daug greičiau, nei gali atsirasti spontaniškai, ir tas pats principas fermentacija taikomas sendinant sūrį.
Palikti vieni tinkamomis sąlygomis, kai kurie puvantys vaisiai gali sukelti etilo alkoholio susidarymą. Tačiau įdėjus mielių, ne tik pagreitėja fermentacija, bet ir įvedama visos cheminės reakcijos nuspėjamumas ir kontrolės priemonė.
„Fermentas“ iš graikų kalbos reiškia „su mielėmis“. Kaip naudojama šiandien, tai reiškia biologinis organizmuose esantys katalizatoriai arba medžiagos, kurias gamina gyva sistema ir jos naudai.
Fermentų pagrindai
Pagrindinė visų fermentų funkcija yra katalizuoti medžiagų apykaitos procesus, vykstančius ląstelėje. Oficialesnis fermento apibrėžimas nurodo, kad fermentas turi veikti ne tik gyvos ląstelės reakcijas, bet ir sukurtas organizmo - to paties ar kitokio.
Atskirus fermentus galima apibūdinti atsižvelgiant į jų fermentus specifiškumas. Tai matas, kaip išskirtinis fermento santykis su juo substratas arba substratai. Pagrindai yra molekulės, prie kurių jungiasi fermentai, dažniausiai reagentai. Kai fermentas vienos reakcijos metu jungiasi tik prie vieno substrato, tai reiškia absoliutus specifiškumas. Kai jis gali prisijungti prie daugybės skirtingų, bet chemiškai panašių substratų, fermentas turi grupė specifiškumas.
Fermentų veikla
Fermentų veikimas - tai yra, kiek jie sugeba paveikti reakcijas, į kurias nukreipia, palyginti su neutraliomis sąlygomis, priklauso nuo daugelio veiksnių. Tai apima temperatūrą ir rūgštingumą, kurie daro įtaką visų baltymų, ne tik fermentų, stabilumui.
Kaip ir galima tikėtis, padidinus substrato kiekį, reakcijos greitis gali padidėti, jei tik fermentas jau nėra „prisotintas“; Atvirkščiai, fermentų pridėjimas gali pagreitinti reakciją esant tam tikram substrato lygiui ir leisti pridėti daugiau substrato, neperžengiant gamybos ribos.
Substrato išnykimo (ir reagento išvaizdos) greitis reakcijose, kuriose dalyvauja fermentai, nėra tiesinis, o linkęs sulėtėti, kai reakcija baigiasi. Tai koncentracijos ir laiko grafike rodo nuolydis žemyn, kuris laikui bėgant tampa laipsniškesnis.
Gerai žinomi fermentai
Beveik bet kuriame fermentų, kuriuose yra žinomiausių ir geriausiai ištirtų fermentų, beveik neabejotinai yra glikolizės katalizatorių - citrinų rūgšties (t. Y. Krebsas arba trikarboksirūgštis) ciklas arba abu. Šie procesai, kurių kiekvienas susideda iš kelių atskirų reakcijų, apima gliukozės suskaidymą į piruvatą ląstelėje citoplazma ir piruvato virtimas rotacine tarpinių medžiagų serija, kuri galiausiai leidžia atsirasti aerobiniam kvėpavimui.
Du fermentai, dalyvaujantys ankstyvojoje glikolizės dalyje, yra gliukozės-6-fosfatazės ir fosfofruktokinazė, kadangi citrato sintazė yra pagrindinis citrinos rūgšties ciklo dalyvis.
Ar pagal jų pavadinimus galite nuspėti, ką šie fermentai gali padaryti? Jei ne, bandykite dar kartą po maždaug penkių minučių.
Fermentų nomenklatūra
Fermento pavadinimas gali lengvai nenusisukti nuo liežuvio, tačiau tokia yra chemijos priėmimo kaina. Daugumą pavadinimų sudaro du žodžiai, iš kurių pirmasis identifikuoja substratą, ant kurio veikia fermentas o antrasis signalizuoja apie reakcijos tipą (daugiau apie šį antrąjį požymį kitame skyrius).
Nors didžioji dalis fermentų pavadinimų baigiasi „-ase“, daugybė svarbių ir gerai ištirtų nevartoja. Bus įtrauktas bet koks fermentų, susijusių su žmogaus virškinimu, sąrašas tripsino ir pepsinas. Tačiau fermento priesaga „-azė“ pati savaime nereiškia nieko kito, kaip tik tai, kad aptariamas baltymas iš tikrųjų yra fermentas ir jis nenagrinėja funkcinių detalių.
Fermentų klasės
Yra šešios pagrindinės fermentų klasės, suskirstytos į kategorijas pagal jų funkciją. Dauguma šių klasių taip pat apima pogrupius. Jų vardai padeda nustatyti, ką jie daro, bet tik tuo atveju, jei mokate graikų ar lotynų kalbas.
- Oksidoreduktazės yra fermentai, dalyvaujantys reakcijose, kuriose yra arba substratas oksiduotas (t. y. praranda elektronus) arba sumažintas (t. y. gauna elektronus). Pavyzdžiai gali būti fermentai, besibaigiantys dehidrogenazė, oksidazė, peroksidazė ir reduktazės. Laktato dehidrogenazė, kuris katalizuoja laktato ir piruvato konversiją fermentacija, priklauso oksidoredukatazių klasei.
- Transferazės, kaip siūlo pavadinimas, perkelkite funkcines grupes, o ne tik elektronus ar pavienius atomus, iš vienos molekulės į kitą. Kinazės, kurie prideda fosfatų grupes į molekules (pvz., fosfatų grupės pridėjimas prie fruktozės-6-fosfato glikolizės metu) yra pavyzdžiai.
- Hidrolazės katalizuoja hidrolizės reakcijas, kurių metu vandens molekulė („hidro-“) naudojama atskiriant didesnę molekulę („-lazą“), kad suskaidytų ją į mažesnes. Fosfatazės, kurios yra kinazių funkcinės priešingybės, tai daro pašalindamos fosfatų grupes; proteazės, peptidazės ir nukleazės, kurie skaido baltymų turinčias molekules, yra antrasis potipis.
- Liazės sukurkite dvigubus ryšius molekulėje, pašalindami grupę iš anglies atomo. (Atvirkštinėje reakcijoje prie vieno iš dvigubos jungties anglies atomų pridedama grupė, kad jis virstų viengubu ryšiu.) Fermentai, kurių pabaiga yra dekarboksilazė, hidratazė, sintazė ir liazė pati yra pavyzdžiai.
- Izomerazės katalizuoti izomerizacijos reakcijas, kurios yra molekulės pertvarkymai, siekiant sukurti izomeras, molekulė su tuo pačiu atomų skaičiumi ir rūšimis (tai yra ta pati cheminė formulė), bet kitokios formos. Taigi jie yra tam tikra transferazė, tačiau vietoj judančių grupių tarp molekulių, jie tai daro molekulėse. Izomerazė, mutazė ir racemase fermentai patenka į šią klasę.
- Ligazės katalizuoti jungties susidarymą per ATP procesą hidrolizė, o ne perkeliant atomą ar grupę iš vienos vietos į kitą. Karboksilazės sintetazė yra a pavyzdys ligazės fermentas.