Dviejų grandžių DNR struktūra yra universali visose gyvose ląstelėse, tačiau skiriasi genomų DNR išskyrimo iš gyvūnų ir augalų ląstelių metodai. Nors genominė DNR gyvena ląstelių branduolyje, išgaunamos DNR kiekis ir grynumas priklauso nuo ląstelės tipo ir dydžio. Pavyzdžiui, tam tikrose ląstelėse yra daugiau DNR ir priemaišų nei kitose. Skaitykite toliau, kad sužinotumėte daugiau apie DNR išskyrimo skirtumus.
Bendras DNR išskyrimas
Jei augalų ir gyvūnų ląsteles gydysite muiluota medžiaga, tai suskaidys ląstelės ir branduolio membranų lipidus. Tada DNR mišinys atsiskirs nuo ląstelių membranų ir baltymų. Tada galite naudoti alkoholį, kad nusodintumėte tirpale esančią DNR. Priklausomai nuo mėginio kiekio, DNR gali būti matoma plika akimi. Tačiau nepamirškite, kad ši paprasta procedūra nebūtinai sukuria labai gryną DNR.
Augalų ir gyvūnų ląstelės
Augalų ląstelės skiriasi nuo gyvūnų ląstelių dėl standžios ląstelių sienelės ir organelių, tokių kaip chloroplastas. Juose taip pat yra baltymų ir fermentų, kurie vaidina svarbų vaidmenį fotosintezėje. Kai kurios augalų ląstelės turi poliploidiją, o tai reiškia, kad kiekvienoje ląstelėje yra daugiau nei viena kiekvienos chromosomos kopija. Be to, ląstelių procesai, vykstantys augaluose, tokie kaip fotosintezė, gamina daugybę antrinių metabolitų. Gyvūnų ląstelės neturi ląstelės sienelės, tačiau joms vis tiek reikia chemikalų, tokių kaip natrio dodecilsulfatas (SDS), kad sutrikdytų ląstelės membraną ir išlaisvintų genomo DNR.
Augalų DNR išskyrimas
Augalo genomo DNR yra sunkiau išgauti dėl augalo ląstelių sienos. Galite jį pašalinti homogenizuodami arba pridėdami celiuliozę, kad suskaidytų celiuliozę, kuri sudaro ląstelės sienelę. Be to, augalo ląstelėje esantys metabolitai gali trukdyti genomo DNR išskyrimui užteršdami DNR mėginį nusodinimo procese.
Gyvūnų DNR išskyrimas
Periferinio kraujo leukocitai yra pagrindinis gyvūnų genomos DNR šaltinis, tačiau mėginius imti sunku, nes kraujas turi būti tiesiogiai iš gyvūno. Kraujyje yra daugybė junginių, tokių kaip baltymai, lipidai, baltieji kraujo kūneliai, raudonieji kraujo kūneliai, trombocitai ir plazma, kurie gali užteršti DNR mėginį. Tačiau pagrindinis iš kraujo mėginių išgaunamos gyvūninės DNR teršalas yra hemas, kuris yra nebaltyminis hemoglobino komponentas.
DNR skirtumai
Augalų ir gyvūnų DNR skirtumai slypi spiralės bazių sekoje. Augalinėse ląstelėse randamų junginių nėra gyvūnų ląstelėse, ir tai atspindi DNR bazių sekos. Be to, genomo augalo DNR dažnai būna didesnė už gyvūnų DNR. Šie skirtumai taip pat turi įtakos ekstrahavimo metodams, derliui ir DNR grynumui.