Prieš metus buvo įrodyta, kad dezoksiribonukleorūgšties - DNR - struktūra yra dviguba spiralė, tačiau kiekvienos krypties pavadinimo sutartis tapo painiava tiek mokslininkams, tiek studentams. Tarp DNR porų viena vadinama Watson, o kita Crick, po dviejų bendrų DNR atradėjų. Tačiau mokslinėje literatūroje nesutariama, kuri sritis turėtų būti pavadinta. „Watson-Crick“ pavadinimų sistema buvo skirta atskiroms funkcinėms savybėms nurodyti kiekvienai grandinei DNR struktūroje, o tai yra tas pats kitų vardų sistemų tikslas. Labai svarbu suprasti skirtingus kontekstus, kuriuose atskiros sruogos turi įgyti skirtingus pavadinimus. Du puikūs pavyzdžiai yra jų skirtingi vaidmenys DNR replikacijos ar transkripcijos metu. Žinojimas, ką kiekviena grandinė veikia biologiniame procese, padės išsiaiškinti, kodėl jai buvo suteiktas šis vardas.
„Anti-Sense“ nėra nesąmonė
Transkripcija yra DNR kopijavimo į RNR procesas. Tai atlieka fermentas, vadinamas RNR polimeraze (RNR Pol). RNR Pol skaito tik vieną iš dviejų DNR grandinių, kai ji sudaro RNR molekulę. Dviejų grandžių DNR molekulė yra padalinta ir RNR Pol prisijungia prie vienos grandinės, kurią ji perskaitys ir nukopijuos. Ši grandinė vadinama šablonu arba anti-sense grandine. Gaminama RNR molekulė papildys šablono grandinę, reiškiančią nukleotidus šablono grandinė ir RNR molekulė sutampa tarpusavyje pagal taisykles: adeninas uracilui ir guaninas citozinas.
Šis supranta
Kai RNR yra perrašoma iš DNR, RNR polimerazė prisijungia ir kopijuoja šablono grandinę. Likusi grandinė vadinama koduojančia grandine (žr. 5 nuorodą) arba jutimo grandine. Atsižvelgiant į nukleorūgščių (A porų su T, o G porų su C) bazių poravimosi taisykles, koduojanti arba jutimo DNR grandinė turi tokią pačią seką, kaip ir gaminamos RNR. Išimtis yra ta, kad RNR yra nukleotidas U (uracilas), o ne T (timinas), kurie abu poruojasi su A (adeninu).
Sklandus važiavimas
Prieš mitozę arba ląstelių dalijimąsi ląstelė turi pakartoti savo DNR, kad kiekvienoje dukterinėje ląstelėje būtų vienodas DNR grandinių skaičius. DNR polimerazė yra fermentas, kuris ilgas DNR atkarpas nukopijuoja į daugiau DNR. Replikacijos šakutėje DNR molekulė atsegama ir susidaro burbulas, į kurį slysta polimerazė. Polimerazė prisijungia prie abiejų neišvyniotos DNR grandinių ir pradeda daryti abiejų grandžių kopijas. Viena iš kopijų daroma kaip viena ištisinė grandinė, kuri vadinama pagrindine grandine. DNR replikacija yra dar vienas atvejis, kai DNR grandinės turi skirtingus pavadinimus.
„Stop and Go Traffic“
Antiparalelioji DNR kopėčių struktūra reiškia, kad viena grandinė eina nuo galvos iki uodegos, o kita grandis eina nuo uodegos iki galvos. DNR replikacijos metu DNR polimerazė turi nuskaityti ir nukopijuoti abi sruogas tuo pačiu metu, nors jos eina priešinga kryptimi. Kadangi DNR polimerazė gali nuskaityti ir nukopijuoti DNR grandines tik viena kryptimi - nuo uodegos iki galvos - grandine kad „Polymerase“ susitikimai, orientuoti į galvą iki uodegos, negali būti skaitomi ir kopijuojami kaip tęstiniai sruoga. Ši nuo galvos iki uodegos sruoga nukopijuojama kaip trumpi fragmentai, vadinami Okazaki fragmentais, kurie vėliau susilieja ir sudaro vieną ilgą giją. Atliekant DNR replikaciją, fragmentai susiformavusi grandinė vadinama atsiliekančia grandine.