Amazonės baseino upės iš viso užima mažiausiai 4000 mylių, todėl jos yra didžiausias gėlo vandens plotas pasaulyje. Įvairiose upių buveinėse yra tūkstančiai vandens ir pusiau vandens augalų rūšių, tarp kurių yra sraunūs upeliai, pelkės, pelkės ir rūgščios, lėtai tekančios juodojo vandens upės. Nuo lapkričio iki birželio pagrindiniai vandens keliai užlieja ir užima didelius aplinkinio miško plotus, smarkiai pakeisdami kraštovaizdį ir sukurdami naujas laikinas buveines, kuriose augalai gali klestėti.
Augalų rūšys Amazonės upėse
Amazonės upėse randamų augalų asortimentas skiriasi nuo nepastebimai žydinčių vandens telkinių iki plaukiojančių žolių plaustų ir laipiojančių epifitinių vynuogynų. Tokių žolių pavyzdžiai gali būti vandens paspalų rūšys ir pusiau vandens bambukai (Bambusa spp.), Augantys palei upės krantus.
Amazonės upių žydintys vandens augalai apima Echinodorus rūšis, tokias kaip plačialapis nykštukinis Amazonės kardų augalas (Echinodorus quadricostatus), kuris teikia pirmenybę blankioms juodojo vandens sąlygoms upių. Kiti Amazonės upių žydintys augalai yra subtili vandens žvaigždžių žolė (Heteranthera zosterifolia), arbatžolė (Myriophyllum) elatinoidai) su plunksniniais virpuliais ir Amazonės žolių augalas (Lilaeopsis brasiliensis), kuris, nepaisant savo pavadinimo, iš tikrųjų nėra žolė. Amazonės upėse taip pat gyvena įspūdinga Viktorija amazonica ir kitos vandens lelijos.
Epifitiniai vynmedžiai yra įprastas vaizdas Amazonės upėse, ir daugelis šių vynmedžių yra vandens arba pusiau vandens, auga lėtai judančiose pelkėse. Tokių vynmedžių pavyzdžiai yra sumedėję Cissus vynmedžiai, kurie priklauso Vitaceae vynuogių šeimai.