Gėlo vandens ir jūrų aplinka yra pagrindinis vandens ekosistemų lūžis; jūrų aplinkoje yra didelis druskingumo lygis (druskos koncentracija), o gėlavandeniuose rajonuose paprastai yra mažiau nei 1 proc. Gėlųjų vandenų ekosistemos apima tvenkinius ir ežerus, taip pat upes ir upelius. Jūrų ekosistemos apima vandenynus ir koralų rifus.
Tvenkiniai ir ežerai
Tvenkiniai ir ežerai yra santykinai nejudantys vandens telkiniai, kuriuose srovė mažai arba nėra, paprastai izoliuoti nuo kitų vandens telkinių, tokių kaip upės ir vandenynai. Jie yra suskirstyti į tris skirtingas zonas: pakrantės, limnetiškos ir gilios. Pamario zona yra tai, kas yra arčiausiai kranto. Esant dideliam saulės spindulių ir seklių vandenų poveikiui, tai dažniausiai biologiškai įvairiausia vietovė tam tikrame ežere ar tvenkinyje, gyvena kelioms varliagyvių, vandens paukščių, vėžiagyvių, vabzdžių, žuvų ir dumblių rūšims, taip pat plaukiojantiems ir įsišaknijusiems augalų. Limnetiška zona apima ežero / tvenkinio plotą, esantį toliau nuo kranto, tačiau arčiausiai vandens paviršiaus. Ši sritis yra mažiau įvairi nei pakrantės zona, tačiau labiau nei giluminė zona dėl didelio saulės poveikio. Gilioji zona apima giliausią tvenkinio ar ežero plotą. Giliame gyvenime beveik išimtinai vyrauja suyrančios bakterijos ir planktonas.
Upės ir upeliai
Upės ir upeliai yra judantys vandens telkiniai, tekantys iš šaltinio, pavyzdžiui, iš šaltinio ar tirpstant ledynas, iki žiočių, kurios gali būti prie vandenyno, didesnio upelio ar upės ar kokio kito tipo rezervuaras. Vandeniui keliaujant iš šaltinio į burną, ekosistemos aplinka smarkiai keičiasi. Upelio ar upės šaltinis turi didžiausią grynumo ir deguonies kiekį. Per visą savo kelią tekantis vanduo savo srovėje renka nuolaužas; tuo metu, kai vanduo pasiekia burną, vanduo tampa drumstas. Todėl mažai saulės spindulių prasiskverbia į paviršių, o augalų gyvenimas yra menkas. Šiose vietovėse klesti tokios žuvų rūšys kaip šamas, kurios gali išgyventi esant mažai deguonies.
Vandenynai
Vandenynai yra viena iš pačių įvairiausių ir geografiškai plačiausių ekosistemų žemėje. Vandenyno ekosistemos skirstomos į keturias zonas: potvynio, pelaginės, dugno ir bedugnės. Potvynių zona apima regionus, kuriuose vandenyno vandenys susitinka su žeme. Ši zona yra labai dinamiška dėl nuolatinio potvynių poveikio. Paprastai rūšių įvairovė yra didesnė potvynio zonose, kurias dažniausiai panardina vanduo. Panašiai kaip limnetiška ežerų zona, pelaginė zona apima atvirą vandenyną nuo kranto, tačiau arčiau vandens paviršiaus. Šiame regione gyvena įvairios žuvys, vandens augalai ir stambesni žinduoliai. Bentoso ir bedugnės zonos apima atitinkamai antrą ir giliausią vandenyno regionus. Dėl didelio slėgio, tamsos ir šaltos temperatūros šiose zonose yra labai skirtingų gyvenimo formų. Norėdami išgyventi visišką saulės spindulių trūkumą, augalai ir bakterijos bedugnės zonoje surenka cheminę energiją iš šiluminių angų, esančių po vandenyno dugnu.
Koraliniai rifai
Koralų rifų ekosistemos yra vandenyne; tačiau dėl savo fizinės ir biologinės sudėties jie labai skiriasi nuo kitų jūrų ekosistemų. Koralų rifai formuojasi sekliuose vandenyse, kur temperatūra yra šilta. Daugelis šių ekosistemų susiformavo palei žemynų krantus. Nors tai gali atrodyti kaip didžiulė uola, koralų rifas iš tikrųjų susideda iš gyvų gyvūnų kolonijų, kurios įsitvirtina kietame kalcio karbonato apvalkale. Šios kolonijos turi simbiotinį ryšį su zooxanthellae - dumblių rūšimi, kuri gyvena ir viduje, ir teikia maistą koralams. Nors koraliniai rifai apima palyginti nedidelį plotą, jie yra vieni iš biologiškai įvairiausių ekosistemų žemėje. Didžiulė kempinių, vėžiagyvių, jūrų anemonų, žuvų, dumblių, vandens augalų ir vabzdžių įvairovė gyvena išskirtinai koralų rifų ekosistemose.