Ekosistema apibūdina visus gyvus organizmus (biotinius komponentus) su jų fizine aplinka (abiotiniais komponentais) tam tikroje srityje. Bendruomenė apibūdina tik gyvus organizmus ir jų tarpusavio sąveiką.
Negyvosios ekosistemos dalys, tokios kaip maistinės medžiagos, temperatūra ir vandens prieinamumas, yra abiotiniai ekosistemos komponentai.
Visi gyvi ekosistemos organizmai, tokie kaip augalai, gyvūnai ir mikrobai, yra biotiniai ekosistemos komponentai.
Ekosistemos populiacijų sąveika apibūdinama naudos ar žalos, padarytos kiekvienai rūšiai sąveikos metu. Šios sąveikos yra susijusios su niša, kurią rūšis užima ekosistemoje.
Niša apibūdina konkretų gyventojų vaidmenį ekosistemoje. Tai gali būti apibrėžta pagal jų sąveiką su kitais organizmais (pvz., Plėšrūnu ar grobiu) arba pagal jų vaidmenį atliekant maistinių medžiagų apykaitą (pvz., Pirminį augintoją ar skaidytoją).
Ekosistemose, kuriose gausu biologinės įvairovės (daug skirtingų rūšių), paprastai yra labai specializuotos nišos. Dėl mažos biologinės įvairovės kiekviena niša užpildoma nedaug rūšių. Taigi turtingoje ekosistemoje vieno organizmo praradimas ar sumažėjimas gali turėti mažesnį poveikį visai ekosistemai kaip kiti organizmai užpildo tuštumą nei skurdžioje ekosistemoje, kur kitai populiacijai to pasiekti negali būti vaidmuo. Pavyzdžiui, jei tam tikros rūšies grobio skaičius yra sumažėjęs, jis turi silpnesnį poveikį plėšrūnams, jei yra kitų grobio rūšių.