Kaip apskaičiuoti Kcat

Nubraižykite produkto koncentracijos ir laiko diagramą duomenims iš pirmojo fermentinio tyrimo mėgintuvėlio. Pastaba: horizontali ašis turėtų būti „laikas“, o vertikalioji - „produkto koncentracija“.

Apskaičiuokite duomenų taškų, kuriuos nubrėžėte 1 skyriaus 1 veiksme, linijinę regresijos liniją. Nors „Excel“ ir grafikų skaičiuoklės gali lengvai nustatyti šį tiesinį modelį, galite gauti regresijos įvertį linijos nuolydis padalijant produkto koncentracijos skirtumą tarp gretimų duomenų taškų iš jų laiko skirtumo.

Užrašykite tiesinės regresijos tiesės nuolydį iš 1 skyriaus 2 žingsnio kaip „pradinį reakcijos greitį (Vo)“. Pastaba: regresijos tiesės modelyje „[produkto koncentracija] = m [laikas] + b“ koeficientas „m“ yra nuolydis.

Pakartokite 1, 2 ir 3 veiksmus likusiems bandymo mėgintuvėliams.

Nubraižykite atvirkštinę kiekvieno mėgintuvėlio substrato koncentracijos ir atvirkštinio jo pradinio reakcijos greičio vertę (iš 1 skirsnio 4 žingsnio). Pavyzdžiui, jei pradinis mėgintuvėlio, kurio pradinė substrato koncentracija yra 50 mikromolių, greitis (uM) buvo 80 uM / s, inversijos bus 1/50 uM substrato koncentracijai ir 1/80 uM / s pradiniam greitis. Pastaba: atvirkštinė substrato koncentracija turėtų būti horizontalioje ašyje, o atvirkštinis pradinis greitis turėtų būti vertikalioje ašyje.

instagram story viewer

Pastaba: substrato koncentracija turėtų būti ant horizontalios ašies, o pradinis reakcijos greitis turėtų būti vertikalios ašies.

Nustatykite diagramos, kurią nubrėžėte 2 skyriaus 1 veiksme, linijinę regresijos liniją. Pastaba: kadangi jums reikės žinoti regresijos tiesės y sankirtą, taškus turėtumėte įvesti iš 2 skyriaus 1 veiksmas į „Excel“ arba grafikų skaičiuoklę ir naudokite įmontuotą regresijos modeliavimą funkcionalumas.

Padalinkite 1 iš y sankirtos nuo tiesinės regresijos tiesės. Tai suteiks jums atvirkštinę Vmax vertę, didžiausią fermento reakcijos greitį. Pastaba: jei linijinės regresijos modelis įgauna formą „[Inverse Vo] = m [Inverse Substrate Conc.] + B“, tada „b“ reikšmė bus y sankirta. Norėdami apskaičiuoti atvirkštinę Vmax vertę, padalykite 1 iš „b“.

Norėdami apskaičiuoti faktinę Vmax vertę, padalykite 1 iš 2 skyriaus 3 žingsnio rezultato.

Nustatykite fermento koncentraciją pradiniame tyrime (žr. Neapdorotus duomenis). Pastaba: fermentų koncentracija vienoda visuose mėgintuvėliuose; tyrime skiriasi tik substrato koncentracijos.

Padalinkite Vmax (iš 2 skirsnio 4 žingsnio) iš fermento koncentracijos (iš 2 skyriaus 5 žingsnio). Rezultatas yra Kcat vertė.

Čikagoje įsikūręs reklamos autorius Andy Pasquesi turi didelę patirtį rašant automobiliams (BMW, MINI Cooper, Harley-Davidson), finansinėms paslaugoms (Ivy Funds, William Blair, T.). Rowe Price, CME Group), sveikatos priežiūros (Abbott) ir vartojimo prekių (Sony, Motorola, Knoll) klientams. Harvardo universitete jis turi anglų kalbos bakalaurą, tačiau Oksfordo kablelis jam nerūpi.

Teachs.ru
  • Dalintis
instagram viewer