Agarose Gel을 해석하는 방법

아가 로즈 젤에서 DNA 샘플을 실행하고 사진을 찍으면 나중에 사진을 저장할 수 있으며, 이 시점에서 결과를 분석하고 해석 할 수 있습니다. 원하는 항목의 종류는 실험의 성격에 따라 다릅니다. 예를 들어 DNA 핑거 프린팅을 수행하는 경우 두 샘플 (예: 용의자와 범죄 현장 샘플)의 DNA 조각 크기를 비교하고 싶을 것입니다. 반대로 박테리아의 플라스미드로 작업하는 경우 플라스미드에 삽입물이 포함되어 있는지 확인해야 할 수 있습니다. 결과적으로 젤을 해석하는 방법은 부분적으로 수행 한 실험에 따라 달라집니다. 그럼에도 불구하고 적용 할 수있는 몇 가지 일반적인 규칙이 있습니다.

이 섹션의 지침을 사용해야 할 수도 있고 필요하지 않을 수도 있습니다. Agarose 겔 전기 영동은 플라스미드에 주어진 삽입물이 포함되어 있는지 확인하는 데 자주 사용됩니다. 플라스미드로 작업하지 않는 경우이 섹션을 건너 뛸 수 있습니다. 그러나 그렇다면 다음 지침을 따를 수 있습니다.

절단되지 않은 플라스미드 또는 흠집이있는 플라스미드로 작업하는 경우 위 섹션 1의 절차를 사용하여 크기를 추정 할 수 없습니다. 절단되지 않은 흠집이있는 플라스미드가 선형 DNA와 다른 속도로 이동하기 때문입니다.

각 차선의 대역 수를 비교하십시오. 제한 효소는 제한 부위라고하는 주어진 서열이 발생하는 부위에서 DNA를 절단한다는 것을 상기하십시오. 샘플이 2 개의 제한 효소로 처리 된 경우 삽입 용 밴드와 나머지 플라스미드 용 밴드가 모두 존재해야합니다. 삽입물이 각각 다른 효소에 대한 두 개의 제한 부위 옆에 있기 때문에이 두 부위에서 절단하면 삽입물이 플라스미드에서 분리됩니다. 대조적으로 한 부위에서만 절단하면 플라스미드가 선형 DNA로 변환됩니다. 제한 효소가 없거나 하나의 제한 효소로 절단 된 샘플은 단일 밴드가 있어야하며, 두 개의 제한 효소로 절단 된 샘플은 두 개의 밴드가 있어야합니다.

닉이있는 플라스미드 DNA에 의해 생성 된 밴드를 찾으십시오. 닉 플라스미드는 단일 가닥으로 만 절단되므로 절단 된 플라스미드보다 더 느리게 이동합니다. 절단 플라스미드는 절단되지 않은 DNA보다 천천히 이동합니다.

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섹션 1에 설명 된 절차를 사용하여 삽입물의 크기를 추정하고 예상과 일치하는지 확인합니다 (실험에 따라 다름).

필요한 것

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  • 스프레드 시트 프로그램
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