როგორ გავიგოთ ნაკადის ციტომეტრიის შედეგები

მეცნიერები იყენებენ დინების ციტომეტრიას, რომ განასხვაონ სხვადასხვა ტიპის უჯრედები ან მიკროსკოპული ორგანიზმები. ეს არის ინსტრუმენტი, რომელიც გამოიყენება ბევრ პროგრამაში, როგორიცაა სამედიცინო დიაგნოსტიკა ან სასამართლო პათოლოგია. მიუხედავად იმისა, რომ ამ ექსპერიმენტული ტექნიკის განხორციელება საკმაოდ მარტივია, წარმოებული კომპლექსური მონაცემების ანალიზი ნაკადის ციტომეტრით უფრო რთულია მრავალი ექსპერიმენტული ფაქტორის ან / და ციტომეტრის გამო პარამეტრები. როგორც ასეთი, ციტომეტრიული მონაცემების ვიზუალიზაცია და ანალიზი ხდება დახვეწილი პროფესიონალური პროგრამების გამოყენებით, როგორიცაა CELLQuest ან FlowJo. ნაკადის ციტომეტრიის ტექნიკის, ტექნიკისა და პროგრამული უზრუნველყოფის გაცნობა აუცილებელია მათ მიერ წარმოებული შედეგების გასაგებად ექსპერიმენტები.

განმარტეთ ექსპერიმენტის მიზანი შემდეგი კითხვით: "რა იყო გამოკვლეული კითხვა ან ჰიპოთეზა?" Ეს იქნება საჭიროა ნედლი შედეგების შესაბამის ფორმატთან და პარამეტრების შემდგომი ანალიზისთვის სტატისტიკური ციტომეტრიის გამოყენებით პროგრამული უზრუნველყოფა შეიტანეთ ნებისმიერი ცვლილება, რომ მონაცემები შესაბამისი პარამეტრებით იყოს ნაჩვენები (მაგ. დადებითი უჯრედები, ნეგატიური კარიბჭეები, ფლუორესცენტის ინტენსივობა, უჯრედების პოპულაციები და ა.შ.).

იპოვნეთ კარიბჭეები. უჯრედების დაჯგუფება ან უბრალოდ დაკვირვება ხდება მტევანზე სიმკვრივის ნახაზზე ან კონტურულ დიაგრამაზე. ჯგუფები ხშირად ერთმანეთისგან განცალკევებულია, მათი იდენტურობიდან გამომდინარე. თუ ერთი ჯგუფი ძალიან ინტენსიურად იჟღინთება კონკრეტული მარკერის ან ანტისხეულისთვის, დაასკვნეს, რომ ამ ჯგუფის წევრებს აქვთ კონკრეტული უჯრედის ტიპის იდენტურობა, რომელიც გამოხატავს ამ მარკერს. ხშირია ამ უჯრედების ერთზე მეტი დადებითი უჯრედების პოვნა და ეს უჯრედები, როგორც წესი, შუალედურია და აღინიშნება, როგორც "ორმაგი პოზიტიური".

გადახედეთ სკატეგრამებს. უჯრედების ჯგუფების გაფანტვის ნაკვეთში გავრცელების გზა არის უჯრედების ზომის აღნიშვნა. უჯრედები ძალიან დიდი ან მაღალი გაფანტულით, როგორც წესი, დიდი უჯრედებია; ამასთან, ისინი შეიძლება დიდი იყოს მხოლოდ იმიტომ, რომ შეიცავს ციტოპლაზმის მაღალ ნაწილს, ან შეიძლება მაღალი იყოს, რადგან მათ ძალიან დიდი ბირთვი აქვთ. გამოკვლეული ბიოლოგიიდან გამომდინარე, რა თქმა უნდა, ეს ძალიან განსხვავდება ექსპერიმენტებს შორის.

ციფრებს გადახედე. დაარეგულირეთ ნახაზები ერთ ღერძზე (ჩვეულებრივ X ღერძზე) სხვადასხვა პარამეტრების ჩვენებისთვის, ხოლო Y- ღერძზე ითვლიან. ეს მიუთითებს იმ პოპულაციის პროპორციაზე, რომელიც დადებითია ამ კონკრეტული პარამეტრისთვის, პიკი ჩვეულებრივ შეიმჩნევა დადებითად შეღებილ ნიმუშში, რომელიც არ იქნება უარყოფითი კონტროლიდან ნიმუში.

გადახედეთ მრავალპარამეტრიან ჰისტოგრამებს. X- ღერძისა და Y ღერძის რეგულირებით თითოეული წარმოადგენს განსხვავებულ პარამეტრს, რომელიც იყო ექსპერიმენტის დროს გამოკვლეული, შესაძლებელია უფრო კარგად გავეცნოთ თვისებებს ნიმუში. მაგალითად, X ღერძის წითელ ფლუორესცენტად და Y- ღერძის მწვანე ფლუორესცენტად დაყენებით, კვადრატული სტილის ჭიშკრების გამოთვლა შესაძლებელია ნიმუში, რათა ნახოთ კვადრატის ოთხი რეგიონი, რომელშიც არის უჯრედები და ლაქები აქვთ წითელი ან მწვანე ფლუორესცენტისთვის, ორივე ფერის ან არცერთი ყველა ეს საშუალებას იძლევა ჰეტეროგენული ნიმუში დაიყოს მის კომპონენტებად და ვიზუალიზირდეს და შეფასდეს ნებისმიერი გადაფარებული სუბიექტი.

გამოყენებული ლიტერატურა

  • "ნაკადის ციტომეტრიის მონაცემების ანალიზი"; სიუზან შაროუ; 1991
  • ”ნაკადის ციტომეტრია: აპარატურა და მონაცემთა ანალიზი”; მარვინ ვან დილა; 1985
  • "ნაკადის ციტომეტრიის პროტოკოლები"; ტერეზა და რობერტ ჰოული; 2004

ავტორის შესახებ

პალმერ ოუიუნგი ფლობს ხელოვნების მაგისტრის საერთაშორისო ბიზნესში კალიფორნიის უნივერსიტეტიდან სან დიეგოში და ა ხელოვნების ბაკალავრი სოციოლოგიაში სანტა ბარბარეს კალიფორნიის უნივერსიტეტიდან და არის გაწვრთნილი მოლეკულა ბიოლოგი. 2006 წლიდან არის დამოუკიდებელი მწერალი. მწერლობის გარდა, ის არის Forex– ის სრული დროით მოვაჭრე და ინტერნეტ მარკეტინგის სპეციალისტი.

ფოტო კრედიტები

Polka Dot RF / Polka Dot / გეტის სურათები

  • გაზიარება
instagram viewer