რას აკეთებს ეთანოლი დნმ – ის მოპოვების დროს?

მეცნიერებს შეუძლიათ დაანგრიონ დნმ-ის თანმიმდევრობა მის შემადგენელ ნუკლეოტიდებში, რომლებსაც, მაგალითად, შეუძლია უთხრას ადამიანს, აქვს თუ არა მათ გენეტიკური დაავადება. დნმ-ის ექსტრაქციის გავრცელებული მეთოდები მოიცავს იზოპროპანოლის ან ეთანოლის გამოყენებას პროცესის ერთ ეტაპზე. ამასთან, უჯრედები შეიცავს უამრავ სხვა მოლეკულას, როგორიცაა ცილები და ლიპიდები, და ბუნებრივად მეცნიერებს სურთ მიიღონ დნმ-ის მაქსიმალურად სუფთა ხსნარი.

დნმ-ის ექსტრაქციის მეთოდები, როგორც წესი, მოიცავს რამდენიმე ნაბიჯს: საჭიროა უჯრედების გახსნა, საჭიროა მემბრანის ლიპიდების მოცილება და დნმ-ის გამოყოფა ცილებისგან, რნმ-ისგან და სხვათაგან დამაბინძურებლები. ორი ტიპიური პროტოკოლია ტუტე ლიზი ბაქტერიული პლაზმიდის დნმ-ის ექსტრაქციისა და ფენოლ-ქლოროფორმის ექსტრაქციისთვის. ორივე მეთოდით, ნუკლეინის მჟავების ეთანოლის ან იზოპროპანოლის დალექვა ერთ-ერთი ბოლო ეტაპია. დნმ-ის ან რნმ-ის დალექვის შემდეგ (ხსნარიდან ამოვარდნილია), იგი შეიძლება განმეორდეს წყალში.

ეთანოლიც და იზოპროპანოლიც კარგად ურევენ წყალს (შეიძლება არ იყოთ), მაგრამ მათ აქვთ დაბალი დიელექტრიკული მუდმივები ვიდრე წყალი, რაც ნიშნავს, რომ მათი შესაძლებლობა დაიცვან დადებითი და უარყოფითი მუხტები ხსნარში და განაწილებულიყვნენ უფრო ღარიბი. მაგალითად, წყლისთვის დიელექტრიკული მუდმივაა 78,5, ხოლო ეთანოლის მუდმივი 24,3. დნმ უარყოფითად იტვირთება, ამიტომ მას იზიდავს პოზიტიური იონები ხსნარში, როგორიცაა კალიუმი ან ნატრიუმი. ეთანოლს წყალზე უფრო დაბალი უნარი აქვს დადებითად დამუხტული იონებისა და დნმ-ის დაშორება.

ეთანოლი ასევე დნმ-ს ნაკლებად ხსნადს ხდის სხვა მიზეზის გამო. მას შემდეგ, რაც ეთანოლის მოლეკულას შეუძლია შექმნას ურთიერთქმედება, რომელსაც წყალბადის კავშირები ჰქვია წყლის მოლეკულასთან, ისინი ამცირებენ წყლის მოლეკულების რაოდენობას დნმ-ის დასატენიანებლად. ამ ეფექტს და ქვედა დიელექტრიკულ მუდმივას შორის ეთანოლი ძირითადად იწვევს დნმ-ის აგრეგრებას დადებით იონებს ხსნარში, ქმნის მყარ ან ნალექს მილის ძირში. დნმ-ის ნალექები უფრო კონცენტრირდება, რადგან ხსნარში სხვა დამაბინძურებლები ერთდროულად არ ალექსებენ.

ეთანოლის სარეცხი საშუალება ემსახურება აგრეთვე დაბალი მოლეკულური წონის დამაბინძურებლებს, როგორიცაა მარილები და სარეცხი საშუალებები. არჩეული მარილი შეიძლება განსხვავდებოდეს იმისდა მიხედვით, საჭიროა თუ არა ნატრიუმის დოდეცილ სულფატის (SDS) სარეცხი საშუალება ადრეული საფეხურიდან დალექვა; მაგალითად, კალიუმის დოდეცილ სულფატი არ არის ხსნადი და ილექება, ამიტომ ტუტე ლიზისში კალიუმის აცეტატის გამოყენებით შეგიძლიათ ამოიღოთ SDS სანამ ეთანოლი / იზოპროპანოლი დაემატება. ეთანოლი ასევე შეიძლება გამოყენებულ იქნას რნმ-ის დასალექებლად იმავე მიზეზების გამო, თუმცა რნმ-ს ნალექი ჩვეულებრივ მეტ ეთანოლს მოითხოვს.