რა გავლენას ახდენს ტუტე pH- ი დნმ-ის სტრუქტურაზე?

ჩვეულებრივ, თქვენი უჯრედების შიგნით დნმ-ის თითოეული მოლეკულა შეიცავს ორ ძაფს, რომლებიც შეერთებულია ურთიერთქმედებით, სახელწოდებით წყალბადის ობლიგაციები. პირობების ცვლილებამ შეიძლება დნმ-ის "დენატურაცია" გამოიწვიოს და გამოიწვიოს ამ შრის განცალკევება. ძლიერი ბაზების დამატება, NaOH– ის მსგავსად, მკვეთრად ზრდის pH– ს, ამცირებს ხსნარის წყალბადის იონების კონცენტრაციას და ორმაგი ჯაჭვური დნმ – ის დენატურაციას.

ჰიდროქსიდის იონის კონცენტრაციას და pH- ს პირდაპირი კორელაცია აქვთ, რაც ნიშნავს, რაც უფრო მაღალია pH, მით უფრო მაღალია ჰიდროქსიდის კონცენტრაცია. ანალოგიურად, რაც უფრო დაბალი მოდის წყალბადის იონის კონცენტრაცია. მაღალ pH– ზე, ხსნარი მდიდარია ჰიდროქსიდის იონებით და ამ უარყოფითად დამუხტულ იონებს შეუძლიათ წყალბადის იონების მოლეკულების მოშორება დნმ – ში არსებული ფუძის წყვილიდან. ეს პროცესი არღვევს წყალბადის შეერთებას, რომელიც დნმ-ის ორ ძაფს აერთიანებს და იწვევს მათ გამოყოფას.

რნმ-ისგან განსხვავებით, დნმ-ს აკლია ჰიდროქსილის ჯგუფი 2 'პოზიციაზე თითოეულ შაქრის ჯგუფში. ეს განსხვავება დნმ-ს ბევრად უფრო სტაბილურს ხდის ტუტე ხსნარში. რნმ – ში, ჰიდროქსილის ჯგუფს 2 'პოზიციაზე შეუძლია წყალბადის იონის დათმობა ხსნარში მაღალი pH– ით, უაღრესად რეაქტიული ალკოქსიდის იონის შექმნა, რომელიც თავს ესხმის ფოსფატის ჯგუფს, რომელსაც ორი მეზობელი ნუკლეოტიდი აქვს ერთად. დნმ არ განიცდის ამ დეფექტს და, შესაბამისად, მაღალი pH– ით შესანიშნავი სტაბილურობით სარგებლობს.

მოლეკულური ბიოლოგები ხშირად იყენებენ ტუტე დენატურაციას პლაზმური დნმ-ის ბაქტერიებისგან იზოლირებისთვის. პლაზმიდები არის ბაქტერიული ქრომოსომისგან გამოყოფილი დნმ – ის პატარა მარყუჟები. ტუტე ლიზისის მინიპრეპში ბიოლოგები ხსნარში შეჩერებულ ბაქტერიებს უმატებენ სარეცხ და ნატრიუმის ჰიდროქსიდს. სარეცხი ხსნის ბაქტერიულ უჯრედის მემბრანს, ხოლო ნატრიუმის ჰიდროქსიდი აძლიერებს pH– ს და ხსნარს ძალიან ტუტე ხდის. როგორც გატეხილი უჯრედები ათავისუფლებენ მათ შინაარსს, შიგნით დნმ გამოყოფს მის შემადგენელ ბოჭკოებად ან დენატურებად.

მას შემდეგ რაც ბიოლოგია უჯრედისგან დნმ-ს გამოიტანს, ის კიდევ ერთ რეაგენტს ამატებს, რომ ხსნარი დაუბრუნოს უფრო ნეიტრალურ pH- ს და ჩამოიბანოს სარეცხი საშუალება. PH– ის ცვლილება საშუალებას აძლევს პლაზმური ძაფების განახლებას; ამასთან, მოცულობითი ქრომოსომა არ შეუძლია იგივე გააკეთოს, ამიტომ ბიოლოგს შეუძლია წაშალოს იგი სარეცხი საშუალებით, დენატურირებული ცილებითა და სხვა ასორტის უსარგებლო ნივთიერებებით და დატოვოს პლაზმიდი. ტუტე ლიზი არ ასუფთავებს პლაზმიდის დნმ-ს; უფრო მეტიც, იგი ემსახურება როგორც "სწრაფ და ბინძურ" საშუალებას მისი უჯრედიდან მოპოვებისა და სხვა დამაბინძურებლების მოსაშორებლად.