როგორ შევადგინოთ დნმ-ის მოდელი

აკადემიური ან სადემონსტრაციო მიზნებისათვის მოდელები ბევრად უფრო სასარგებლოა, თუ მათ სათანადო ნიშნები აქვთ. ეტიკეტები უნდა იყოს ზუსტი, გასაგები და იკითხება.

რაც უფრო რთულია მოდელი, მით უფრო მნიშვნელოვანი ხდება შესაბამისი მარკირება. ა დნმ-ის მოდელი ეტიკეტი სათანადოდ წარმოადგენს ცხოვრების ერთ-ერთ ყველაზე რთულ სტრუქტურას, ელეგანტურად მარტივად გამოსაჩენად.

დეოქსირიბონუკლეინის მჟავა (დნმ) სტრუქტურა ჰგავს დაგრეხილ კიბს, რომელიც დამზადებულია ექვსი სხვადასხვა ნაწილისგან. კიბის მხარეები შედგება ორი ნაწილისგან, ხუთი ნახშირბადოვანი შაქრისგან, რომელსაც დეოქსირიბოზა ჰქვია და ფოსფატის მოლეკულა.

კიბის საფეხურები წყვილებისგან ქმნის აზოტოვანი ფუძეები. ადენინი და თიმინი ქმნიან ერთ წყვილს, ხოლო ციტოზინი და გუანინი ქმნიან მეორე წყვილს.

ქიმიური სტრუქტურების გამო, ეს ბაზები მხოლოდ ამ წყვილებში აერთიანებს. თუ თითოეული ფუძე განსხვავებული ფერით არის ნაჩვენები, მაგალითად ყვითელი ადენინისთვის და ლურჯი თიმინისთვის, მნახველს უფრო მარტივად გაუგებარია მოდელი.

(იხილეთ რესურსები დნმ მოდელის აგების პრაქტიკისთვის).

წყალბადის ობლიგაციები გამართეთ აზოტოვანი ფუძის წყვილი ერთად, მაგრამ წყვილები დაშორდით დნმ-ის მოლეკულის გამეორებისას. პროექტის ინსტრუქციებიდან გამომდინარე, ეს წყალბადის ბმები შეიძლება იყოს ნაჩვენები ან არ არის ნაჩვენები. საჭიროების შემთხვევაში, წყალბადის კავშირი დნმ – ის მოდელებში შეიძლება ნაჩვენები იყოს კბილის ჯაგრისების ან მცირე მაგნიტების გამოყენებით, ან კონსტრუქტორებად ან ბრჭყვიალა ან ბრჭყვიალა წებებით.

ეტიკეტები უნდა იკითხებოდეს. ლამაზი ან დახვეწილი შრიფტები უფრო რთულ კითხვებს და გაგებას უქმნის ეტიკეტებს, ამიტომ გამოიყენეთ მარტივი შრიფტები, რომლებიც ადვილად იკითხება. ასევე, გამოიყენეთ შესაბამისი ზომის შრიფტი. რაც უფრო დიდია მაყურებლის დაშორება მოდელისგან, მით უფრო დიდია შრიფტის ზომა.

ეტიკეტები უნდა შეიცავდეს საკმარის ინფორმაციას, რომ მოდელი თავისთავად გასაგებია. ყველა ეტიკეტისთვის იგივე ან ძალიან მსგავსი ფორმატის გამოყენება ასევე ეხმარება გაგებას.

კონსტრუქციის შემდეგ, მკაფიოდ და ზუსტად მინიშნეთ დნმ-ის მოდელი და მისი ნაწილები. მოკლე ახსნა-განმარტებები მნიშვნელოვნად შეუწყობს ხელს პროექტს.

დნმ-ს მოდელს უნდა ჰქონდეს უფრო დიდი ეტიკეტი, რადგან ეს არის სრული სტრუქტურის სახელი. დამატებითი ინფორმაცია, რომელიც შეიძლება საჭირო გახდეს, მოიცავს მოდელის მწარმოებლის სახელს, მშენებლობის თარიღს ან ვადას, ინსტრუქტორის სახელს და კლასის სათაურს.

განმარტება დნმ-ის მოლეკულა შესაძლოა პროექტიც იყოს საჭირო. აბზაცის ახსნა, სავარაუდოდ, მოითხოვს მინიმუმ ორმაგი სპირალის სტრუქტურის აღწერას და დნმ-ის მოლეკულის მნიშვნელობის მოკლე განხილვას.

ინსტრუქციას შეიძლება ასევე მოეთხოვებოდეს სტრუქტურის აღმომჩენთა სახელებს (კრიკი და უოტსონი რენტგენის დიფრაქციული სურათების დახმარებით, გადაღებული როზალინდ ფრანკლინისა და მორის უილკინსის მიერ). მიყევით პროექტის მითითებებს.

ფოსფატის მოლეკულის იარლიყი ფოსფატის მოლეკულები შედგება ფოსფატის ატომისგან, რომელიც გარშემორტყმულია ოთხი ჟანგბადის ატომით. ფოსფატის მოლეკულები ქმნიან კავშირებს დნმ-ის მოლეკულის რელსების ან გვერდების გასწვრივ. ირონია დნმ სტრუქტურა ნაწილობრივ მოდის ამ მოლეკულებიდან.

დეოქსირიბოზის მოლეკულის იარლიყით: დნმ-ის გრეხილი კიბის რელსების ან გვერდების მეორე ნაწილი დეოქსირიბოზის მოლეკულაა. დეოქსირიბოზა არის ხუთ შაქრიანი მოლეკულა, რომელსაც რიბოზა ჰქვია, რომელმაც დაკარგა ჟანგბადის ატომი (დეოქსია). ეს მოლეკულა უკავშირდება აზოტოვან ბაზის ჯვარედინ კავშირებს, ან საფეხურები, დნმ – ის კიბის.

ფუძის წყვილების იარლიყით: დნმ-ის კიბეზე თითოეული საფეხური შედგება ერთი ფუძის წყვილისგან, ან ადენინი და თიმინი ან გუანინი და ციტოზინი. ამ ოთხი აზოტოვანი ბაზის ქიმიური სტრუქტურები ხელს უშლის სხვა კომბინაციებს. თუ მიმართულებების თანახმად ბაზებს უნდა აჩვენონ ფარდობითი ზომა, ადენინი და გუანინი ოდნავ უფრო დიდი მოლეკულებია.

ადენინი და თიმინი: სტანდარტული პრაქტიკა იძლევა ადენინის A და თიმინის T მარკირების დაშვებას, მაგრამ მოდელს უნდა ჰქონდეს მინიმუმ ერთი საფეხური, რომელსაც ეწერება სრული სახელები და ასოთა აღნიშვნები.

მაგალითად, ადენინის ერთი აზოტოვანი ფუძე უნდა შეაფასოს ადენინი (A), ხოლო თიმინის თანდართული აზოტოვანი ფუძე უნდა შეაფასოს თიმინი (T). თუ ეს ეტიკეტები ნათლად არის წარმოდგენილი, ადენინის დანარჩენი ფუძეები შეიძლება აღინიშნოს A იარლიყით და პარტნიორი თიმინი შეიძლება აღინიშნოს T. ისევ შეამოწმეთ მიმართულებები.

გუანინი და ციტოზინი: სტანდარტული პრაქტიკა იძლევა გუანინის G- ზე ეტიკეტირებისა და ციტოზინის C- ს, მაგრამ მოდელს უნდა ჰქონდეს მინიმუმ ერთი საფეხური, რომელსაც ეწერება სრული სახელები და ასოთა აღნიშვნები.

მაგალითად, გუანინის ერთი აზოტოვანი ბაზა უნდა იყოს წარწერით გუანინი (G) და ციტოზინის თანდართული აზოტოვანი ბაზა - ეტიკეტი ციტოზინი (C). თუ მასწავლებელი თანახმაა, გუანის დანარჩენი ფუძეები შეიძლება აღინიშნოს G- ით, ხოლო ციტოზინის ფუძეები - C.

თუ მოდელის მოთხოვნებში შედის წყალბადის ბმის ჩვენება, ფრთხილად მონიშნეთ წყალბადის კავშირების ადგილები ადენინისა და თიმინის ბაზებს შორის, აგრეთვე გუანინისა და ციტოზინის ბაზებს შორის.

თუ ეტიკეტი ზუსტად ვერ დაიდება წყალბადის ბმის ადგილას (ადგილებზე), მოათავსეთ რაც შეიძლება ახლოს. ისრები, თუ გამოიყენება, რაც შეიძლება ნაკლებად უნდა გადაკვეთონ მოდელიდან.

განსაზღვრეთ ნუკლეოტიდი: ა ნუკლეოტიდი შედგება ჯგუფისგან, რომელიც შეიცავს ერთ ფოსფატის მოლეკულას, ერთ დეოქსირიბოზას მოლეკულას და ერთ აზოტოვან ფუძეს. ერთი ნუკლეოტიდის იდენტიფიკაციის ეტიკეტზე ნათლად უნდა იყოს ასახული სამი დაკავშირებული მოლეკულა, როგორც ჯგუფი.

ისრები, სტრიქონები ან საიდენტიფიკაციო მარკერები, როგორიცაა ვარსკვლავის შესატყვისი სტიკერები, შეიძლება გამოყენებულ იქნას ნუკლეოტიდის სამი ნაწილის ეტიკეტთან დასაკავშირებლად.