מהם חלקי המיקרוביולוגיה?

מיקרוביולוגיה היא המחקר של אורגניזמים קטנים מכדי שניתן יהיה לראותם עם ראייה ללא סיוע. ניתן לסווג את המיקרוביולוגיה בדרכים רבות ושונות, כיאה לחקר אורגניזמים העולים בהרבה על אורגניזמים רב-תאיים. ניתן לגשת למיקרוביולוגיה כמחקר של חטיבות טקסונומיות שונות, או לחלק אותן על ידי קבוצות האורגניזמים הנחקרים. ניתן לחשוב על מיקרוביולוגיה כאוסף של תחומי מחקר שונים, או לפצל אותה על ידי התחשבות בפעילויות השונות שעושים המיקרוביולוגים.

ביולוגים סיווגו את כל החיים על פני כדור הארץ לאחת משלוש קבוצות טקסונומיות ענקיות הנקראות תחומים: ארכיא, חיידקים ואאוקריה. ארכיא וחיידקים הם פרוקריוטים, אורגניזמים שלתאים אין גרעין מרכזי. כולם אורגניזמים חד תאיים. חיידקים נבדלים בדרך כלל על ידי מבנה ייחודי בכיסוי החיצוני שלהם - קיר תא בנוי ממולקולות הנקראות פפטידוגליקנים. ארכאיות דומות לחיידקים, אלא שהביוכימיה הפנימית שלהם פועלת לפי כללים שונים ורבים מהם מותאמים לסביבות קשות. Eukarya מאופיינים בתאים שיש בהם גרעינים ומבנים פנימיים ייחודיים אחרים בתאים שלהם. אף על פי שאקריוטים רבים הם אורגניזמים גדולים, כמו פילים, עצי סקויה ובני אדם, הרוב המכריע של המינים האוקריוטים הם מיקרואורגניזמים חד תאיים.

דרך נוספת לחלק את חקר המיקרוביולוגיה היא על ידי כל קבוצות האורגניזמים החד תאיים. זה מתעלם מהרמה הטקסונומית של האורגניזמים ולמעשה רואה את כל הישויות שמתחת לגודל מסוים נופלות תחת מטריית המיקרוביולוגיה. זה כולל את החיידקים והארכאים, שהם תחומים, ואת הפטריות, האצות והפרוטוזואה, שהם ממלכות בתחום האאוקריה. הוא כולל גם את הנגיפים, שאינם נמצאים בסיווג טקסונומי כלשהו של אורגניזמים חיים.

פטריות כוללות תבניות ושמרים. אצות הן צמחים חד תאיים, מהסוג שהופך את פני הבריכה לירוקה או צהובה. פרוטוזואה הם כמו חיות חד-תאיות - בדרך כלל הם נעים יותר מאשר אצות או פטריות. נגיפים הם קבוצה אחרת לגמרי של ישויות החופפות את הגבול בין חי ולא חי, אך המחקר שלהם נופל גם תחת מטריית המיקרוביולוגיה.

ניתן לסווג מיקרוביולוגיה גם לפי תחומי המחקר המיקרוביולוגיה. לדוגמא, אימונולוגים חוקרים את המנגנונים של מחלות אנושיות הנגרמות על ידי זיהום חיידקים, פטריות, נגיפים או פרוטוזואה, ואילו אפידמיולוגים חוקרים את האופן שבו הם מופיעים בזיהומים מועבר. מזון ומיקרוביולוגים חקלאיים חוקרים את האופן שבו ניתן להשתמש בפטריות או בחיידקים לייצור מזון - יחד עם המנגנונים שבאמצעותם מיקרואורגניזמים יכולים לפגוע בגידולים. ביוטכנולוגים מחפשים דרכים להשתמש במיקרואורגניזמים לייצור חומרי שימוש לאנושות.

מיקרוביולוגים מבצעים מגוון פעילויות במהלך המחקר שלהם על ישויות מיקרוסקופיות, וכן ניתן לסווג את המיקרוביולוגיה על בסיס פעילויות אלה. אלה מאורגנים בנוחות בקבוצות הנקראות ששת ה"אני ". ששת ה"אני "הללו יכולים להתבטא כחיסון, דגירה, בידוד, בדיקה, חקירה וזיהוי. הם מתייחסים לתהליכי טיפוח, דגימה, תצפית ובדיקת מיקרואורגניזמים.