מראה הצבע בעין האדם הוא פונקציה של הפיגמנטים הכלולים בקשתית העין. צבעים ספציפיים נקבעים על ידי הגנים של הפרט, מה שהופך כמה צבעי עיניים לשכיחים יותר מאחרים.
צבע העיניים הנפוץ ביותר ברחבי העולם הוא חום. כמות גבוהה של מלנין, הפיגמנט הגורם גם לשיער כהה יותר ולגוון עור, יגרום לצבע עיניים חום. עיניים כהות מאוד עשויות להיראות שחורות. עיניים חומות נפוצות בכל הגזעים ובכל חלקי העולם.
צבעי עיניים פחות שכיחים כוללים כחול (נמצא בקרב אנשים ממוצא אירופי עם רמות נמוכות יותר של מלנין), לוז (שילוב של ירוק וחום), אפור (גרסה של כחול מעורבב עם גוונים אחרים) וירוק (בדרך כלל מאוחד לאנשי נורדי מָקוֹר). הנדיר ביותר בין צבעים אלה הוא ירוק עם אחוז אחד עד שניים בלבד מכל האנשים שנולדים עם עיניים ירוקות טבעיות.
צבעי העיניים הנדירים ביותר כוללים ענבר, סגול ואדום. ענבר הוא תוצאה של ליפוכרום פיגמנט צהוב. סבור כי עיניים סגולות הן תוצאה של חוסר פיגמנט מספיק למלא את כל העין, מה שמאפשר לכלי הדם להיראות. אדום, ככל הנראה הנדיר ביותר מכל צבעי העיניים האנושיים, הוא תוצאה של לבקנות, שבה העין חסרת כל פיגמנט.