אורגניזמים החיים בסביבות שפוגעות או הורגות את רוב הדברים נקראים אקסטרופילים. כאשר לאותה סביבה קיצונית יש pH נמוך מאוד, בדרך כלל מתחת לשלוש, הם מכונים אסידופילים. חיידקים חומצופיליים חיים במגוון מקומות, החל מאוורור בקרקעית הים וכלה בתכונות תרמיות ילוסטון לבטן האנושית, ולכולם יש התאמות שיעזרו להם לשרוד בתנאים קשים וחומציים.
הליקובקטר פילורי
הליקובקטר פילורי הוא זן של חיידקים שנמצא בקיבה האנושית ואחראי על 80 עד 90 אחוז מכיבי הקיבה (ראה התייחסות 3). זה בצורת בורג עם כמה דגלים שעוזרים לו לנוע. לקיבה האנושית יכול להיות pH נמוך כמו שניים, חומצי מספיק כדי לנטרל חלבונים, להתחיל לעכל את האוכל שלך ולהרוג את רוב החיידקים. הליקובקטר פילורי הוא אסידופילי, אך יעדיף שלא לבזבז אנרגיה כדי לשמור על בטיחותו מפני ההשפעות המזיקות של החומצה, ולכן הוא מבלה חלק ניכר מזמנו שקוע עמוק בריר הקיבה. כאשר הוא אכן זקוק למעבר ממקום למקום, הוא מבודד את עצמו בבועת מגן של תמיסת חיץ המנטרלת את החומצה.
Thiobacillus acidophilus
Thiobacillus acidophilus הוא דוגמה לתרמו-אסידופיל, כלומר חיידק שאוהב סביבות חמות במיוחד וגם חומציות מאוד. הוא נמצא באגני גייזר חומציים בפארק הלאומי ילוסטון, כמו גם במקומות אחרים. זה גם מעניין מכיוון שהוא מסוגל לפוטוסינתזה, או לקבל את האנרגיה שלו מהשמש. כמו רוב החיידקים האסידופיליים, הוא שורד באמצעות משאבת פרוטון יעילה מאוד כדי למנוע מכניסת יותר מדי אטומי מימן פנימה ולשנות את ה- pH הפנימי שלה.
Acetobacter aceti
רוב החיידקים האסידופיליים משתמשים בהתאמות כדי לשמור על ה- pH הפנימי שלהם ניטרלי, כך שהחומצה לא תנטרל את החלבונים שלהם, אבל Acetobacter aceti שינה את החלבונים שלו כך שהם לא נפגעים מחומציים סביבות. מחקר במיקרוביולוגיה סביבתית יישומית מצא יותר מ -50 חלבונים מיוחדים שהתפתחו כדי לעזור לחיידק להתמודד עם מצבים חומציים. כל ההסתגלות הזו טובה לבני אדם מכיוון שאנחנו משתמשים במין זה ליצירת חומצה אצטית, או חומץ, במשך אלפי שנים.
Oligotropha corboxydovorans
בים העמוק בו לא חודר אור, פתחי אוורור תרמיים על קרקעית הים פולטות חומצה וחומרים רעילים אחרים. פתחי אוורור אלה מהווים בסיס למערכת אקולוגית מדהימה. למול אחד שחי בין פתחי האוורור התרמיים יש מערכת יחסים סימביוטית עם Oligotropha corboxydovorans. המולים מספקים בית והחיידקים צורכים מימן כדי לייצר אנרגיה לשניהם. אטומי מימן הופכים את המערכות לחומציות, וחיידקים אלה מצאו דרך להשתמש במימן ולהפוך את עצמם לתאי דלק זעירים.