מיקרואירופילים הם מיקרואורגניזמים שאינם נהרגים על הסף על ידי נוכחות חמצן כשלעצמם, אך מסוגלים לסבול רק רמות תת-אטמוספריות של חמצן בסביבתם. זה מציב אותם על הספקטרום המטבולי בין אנאירובים מחויבים, שלמעשה נהרגים על ידי חמצן, וחיובי אירובים, הדורשים את אותה רמת חמצן כללית שאתה ורוב החיים האחרים טפסים עושים. חמצן מהווה כ- 21 אחוז מהגזים האטמוספריים של כדור הארץ; מיקרואירופילים גדלים בצורה הטובה ביותר בתקשורת עם פחות מכך במידה ניכרת, אך הם זקוקים לפחות לחלק כדי לפרוח.
חיידקים מיקרואירופיליים הם דוגמאות לאנ-אירובי אוויר-סובלני. חמצן למיקרואירופילים דומה למדינרל כמו ברזל לבני אדם: כל האנשים זקוקים לכמויות קטנות של ברזל כדי לשרוד, אך עודף של ברזל הוא רעיל. חיידקים אלה מייצרים את האנזימים לפירוק תוצרי הלוואי הרעילים של חילוף החומרים האירובי, אך בכמויות מופחתות בהשוואה לאורגניזמים אירוביים.
דוגמאות לחיידקים אווירוטולרנטיים יש בשפע בעולם המחלות זיהומיות (פתוגניות). הסיבה לכך היא בעיקר כי חמצן יכול להגיע לחלקים מסוימים בפנים הגוף, אך לא בכמויות החיצוניות והריאות נחשפות אליהן.
ויבריו
החיידקים בסוג זה ישרים או מעוקלים והם שליליים בגרם בצביעת צבע (חיידקים מסווגים בדרך כלל כגרם חיובי או שלילי גרם). נתרן מטפח
ויבריו צמיחה והם משגשגים בסביבות מים. בקבוצה זו, V. כולרה ו V. פרהאמוליטיקוס הם הגורמים העיקריים למחלות בבני אדם. ויבריו חיידקים עלולים לגרום לשלשולים או לזיהומים מחוץ למערכת העיכול.קמפילובקטר
מיקרואירופילים אלה עשויים להיות בצורת S, מעוקלים או בצורת מוט, והם קשורים לזיהומים במערכת העיכול. לעתים קרובות הם מועברים מבעלי חיים (במיוחד בעלי חיים) לבני אדם, ואפשר לחלות לאחר שרק כמה מאות מהאורגניזמים הללו נכנסו לגוף. אוכל ומים מזוהמים יכולים גם לייצר קמפילובקטר זיהומים.
לגיונלה
לגיונלים הם חיידקים שלילי גרם קטנים הגורמים למחלות נשימה קלות עד חמורות, אפילו קטלניות. הם ידועים לשמצה בפריחה במים מחוממים, כמו אמבטיות עיסוי. לגיונלים נמצאים בגופי מים טבעיים כמו גם בגופים מעשה ידי אדם כמו מיכלי מים חמים. יש 20 מובחנים לגיונלה מינים שקשורים למחלות אנושיות החל משנת 2018.
נייסריה
Neisseriae הם חיידקים שליליים גרם הידועים בעיקר בגרימת זיבה, מחלה המועברת במגע, בבני אדם. החל משנת 2004, האמינו כי 112 מכל 100,000 איש בארה"ב נגועים, או כמאה מכל 900 נפש. ניתן לטפל ביעילות במחלה באמצעות אנטיביוטיקה. במקרים נדירים זה יכול לגרום לזיהום בעין הנקרא דלקת הלחמית.
הליקובקטר
הליקובקטריה הם שליליים בגרם ובדרך כלל מעוקלים או בעלי צורה ספירלית, ומעניקים להם את שמם. התגלה בשנת 1982, הם מאכלסים את המעיים האנושיים והיו מעורבים בדלקת קיבה, או בדלקת בקיבה, יחד עם סוגים מסוימים של כיבים בקיבה. הם יכולים גם להתמיד בגוף לתקופות ארוכות מבלי לגרום למחלות.