מקורות שגיאה בג'ל אלקטרופורזה

אלקטרופורזה ג'ל היא אחת השיטות העיקריות המשמשות בביולוגיה מולקולרית לניתוח ה- DNA. שיטה זו כוללת נדידה של שברי DNA דרך ג'ל, שם הם מופרדים על בסיס גודל או צורה. עם זאת, אפילו שיטה שקולה מבחינה מדעית כגון ג'ל אלקטרופורזה אינה חסינה מטעויות.

•••Jezperklauzen / iStock / Getty Images

אלקטרופורזה של ג'ל כוללת שימוש בג'ל העשוי בדרך כלל מפולימרים כגון אגרוזה. הג'ל טובל בתמיסת חיץ המוליכה שדה חשמלי. דגימת ה- DNA המעניינת מקוטעת תחילה באמצעות אנזימי הגבלה ואז מוזרקת לג'ל. כאשר השדה החשמלי מופעל, שברי ה- DNA בג'ל נודדים לעבר האלקטרודה החיובית. אם שברי ה- DNA הם בגדלים שונים, אז זמני הנדידה יהיו שונים עבור כל שבר בגודל. לאחר מכן מדמיינים את השברים באמצעות צבע או אוטורדיוגרפיה ונראים כלהקות בג'ל.

•••aiaikawa / iStock / Getty Images

היישום העיקרי של אלקטרופורזה הוא כלי לניתוח ה- DNA בביולוגיה המולקולרית, אך הוא משמש גם בפלילי פלילי כאמצעי לזיהוי דגימות מזירת פשע. חשוב למזער את מקורות הטעויות בטכניקה זו על מנת לקבל תוצאות מדויקות. מקור אחד לטעויות הוא זיהום של דגימת ה- DNA. אם יש דנ"א זר בדגימה, לג'ל יהיו יותר רצועות ממה שהיה נמצא בג'ל המכיל רק את הדגימה המטוהרת.

•••IndiaImages / iStock / Getty Images

ריכוז הג'ל חייב להיות נכון גם כדי למנוע טעויות. אם הריכוז גבוה מדי או נמוך מדי, השברים ינדדו לאט או מהר מדי. זה יוביל לשגיאות בפתרון הלהקות השונות. במהלך הריצת האלקטרופורזה יש להקפיד שהמתח יציב. כל תנודות במתח יביאו לנדידה לא יציבה של שברי DNA, מה שיוביל לשגיאות בקריאת הלהקות. תמיסת החיץ חייבת להיות גם מהרכב הנכון, מכיוון שמאגר עם pH שגוי או ריכוז יוני ישנה את צורת שברי ה- DNA, וישנה גם את זמני הנדידה שלהם.

•••הוצאת אינגרם / הוצאת אינגרם / Getty Images

והכי חשוב, יש לדמיין כראוי את הג'ל. אם ריכוז הצבע או החללית הרדיואקטיבית המשמשת להדמיית הדגימות גבוה מדי, התמונה המתקבלת תהיה מבולגנת מאוד, מכיוון שגם דמויות שיור יראו לעין. אם ריכוז הג'ל נמוך מדי, לא תהיה הדמיה. כאשר התהליכים הנכונים עקבו אחר כל השלבים, אלקטרופורזה ג'ל תניב תוצאות מדויקות וניתן להשתמש בהן בביטחון רב. כמו בכל ההליכים המדעיים, ג'ל אלקטרופורזה יכול להיות מועד לטעויות, אך ניתן למזער את אלה עם הכנה וטיפול נאותים.