כיצד לתייג מודל DNA

מודלים למטרות לימוד או הדגמה הופכים הרבה יותר שימושיים כאשר הם מתויגים כראוי. התוויות צריכות להיות מדויקות, מובנות וקריאות.

ככל שהמודל מורכב יותר, כך התיוג הנכון הופך לחשוב יותר. א מודל DNA מתויג כראוי מייצג את אחד המבנים המורכבים ביותר של החיים תוך שהוא נראה פשוט באלגנטיות.

החומצה הדאוקסיריבונוקלאית (DNAהמבנה נראה כמו סולם מעוות העשוי משישה חלקים שונים. צדי הסולם מורכבים משני חלקים, סוכר בעל חמישה פחמן הנקרא דאוקסיריבוז ומולקולת פוספט.

שלבי הסולם נוצרים מזוגות של בסיסים חנקניים. אדנין ותימין יוצרים זוג אחד ואילו ציטוזין וגואנין יוצרים את הזוג השני.

בשל המבנים הכימיים שלהם, בסיסים אלה משתלבים רק בזוגות אלה. אם כל בסיס מוצג בצבע שונה, כמו צהוב לאדנין וכחול לתימין, הצופה ימצא הרבה יותר קל להבין את הדגם.

(ראה משאבים לתרגול בניית מודל DNA).

קשרי מימן החזק את זוגות הבסיסים החנקניים יחד, אך תן לזוגות להיפרד כאשר מולקולת ה- DNA משכפל. בהתאם להוראות הפרויקט, קשרי מימן אלה עשויים להופיע או לא. אם נדרש, ניתן להציג את קשר המימן במודלי DNA באמצעות קיסמים או מגנטים קטנים כמחברים או מיוצג באמצעות נצנצים או דבק נצנצים.

התוויות חייבות להיות קריאות. גופנים מפוארים או משוכללים הופכים את התוויות למאתגרות יותר לקריאה ולהבנה, לכן השתמש בגופנים פשוטים וקלים לקריאה. כמו כן, השתמש בגופן המתאים לגודל. ככל שמרחק הצופה גדול יותר מהדגם, כך גודל הגופן צריך להיות גדול יותר.

התוויות צריכות לכלול מספיק מידע שהמודל מובן מעצמו. שימוש בתבנית זהה או דומה מאוד לכל התוויות מסייע גם להבנה.

לאחר הבנייה, תייג את מודל ה- DNA וחלקיו בצורה ברורה ומדויקת. הסברים קצרים והגדרות ישפרו מאוד את הפרויקט.

למודל ה- DNA צריך להיות תווית גדולה יותר מכיוון שזהו שם המבנה השלם. מידע נוסף שעשוי להידרש כולל את שם יצרן הדגמים, תאריך הבנייה או תאריך היעד, שם המדריך וכותרת הכיתה.

הסבר על מולקולת DNA פרויקט עשוי להידרש. הסבר לפיסקה ידרוש ככל הנראה לפחות תיאור של מבנה הסליל הכפול ודיון קצר על המשמעות של מולקולת ה- DNA.

ההוראות עשויות גם לדרוש את שמות מגלים המבנה (קריק ווטסון בעזרת תמונות עקיפה של רנטגן שצילמו רוזלינד פרנקלין ומוריס וילקינס). עקוב אחר הוראות הפרויקט.

תייג את מולקולת הפוספט: מולקולות פוספט מורכבות מאטום פוספט המוקף בארבעה אטומי חמצן. מולקולות הפוספט יוצרות את החוליות לאורך המסילה או הצדדים של מולקולת ה- DNA. הטוויסט ב מבנה DNA מגיע בחלקו מהמולקולות האלה.

תייג את מולקולת deoxyribose: החלק השני של המסילות או הצדדים של הסולם המעוות של ה- DNA הוא מולקולת deoxyribose. Deoxyribose היא מולקולה של חמישה סוכר הנקראת ריבוז שאיבדה אטום חמצן (deoxy-). מולקולה זו מתחברת לקישורי רוחב הבסיסיים החנקניים, או שלבים, של סולם ה- DNA.

תייג את זוגות הבסיס: כל שלב על סולם ה- DNA מורכב מצמד בסיס אחד, אדנין ותימין או גואנין וציטוזין. המבנים הכימיים של ארבעת הבסיסים החנקניים הללו מונעים כל שילוב אחר. אם ההוראות דורשות מהבסיסים להציג גודל יחסי, אדנין וגואנין הם מולקולות מעט גדולות יותר.

אדנין ותימין: פרקטיקה רגילה מאפשרת לסמן אדנין כ- A ותימין כמו T, אך על המודל לכלול לפחות שלב אחד עם התוויות המלאות ושמות האותיות.

לדוגמה, בסיס חנקני אחד של אדנין צריך להיות מתויג אדנין (A), ואת הבסיס החנקני המצורף של תימין צריך להיות שכותרתו תימין (T). אם תוויות אלה מוצגות בצורה ברורה, יתכן ושאר בסיסי האדנין יסומנו בתווית A וניתן לסמן את תימין השותף עם T. שוב, בדוק את ההוראות.

גואנין וציטוזין: תרגול רגיל מאפשר תיוג גואנין כ- G וציטוזין כ- C, אך על המודל לכלול לפחות שלב אחד עם התוויות המלאות ושמות האותיות.

לדוגמא, בסיס חנקני אחד של גואנין צריך להיות מתויג כגואנין (G) ועל הבסיס החנקני המצורף של ציטוזין צריך להיות שכותרתו ציטוזין (C). אם המורה מסכים, ניתן לסמן את שאר בסיסי הגואנין ב- G, ולסמן את בסיסי הציטוזין ב- C.

אם דרישות המודל כוללות הצגת קשר מימן, סמן בקפידה את מיקומי קשרי המימן בין בסיס האדינין והתימין וכן בין בסיס הגואנין לציטוזין.

אם לא ניתן למקם את התווית בדיוק במיקום (ים) של קשרי מימן, הציבו אותה קרוב ככל האפשר. החצים, אם משתמשים בהם, צריכים לחצות כמה שפחות מהדגם.

זהה נוקלאוטיד: א נוקלאוטיד מורכב מקבוצה המכילה מולקולת פוספט אחת, מולקולת דאוקסיריבוז ובסיס חנקני אחד. תווית המזהה נוקלאוטיד אחד צריכה להראות בבירור את שלוש המולקולות המחוברות כקבוצה.

ניתן להשתמש בחצים, בחוטים או בסמנים מזהים כמו מדבקות כוכבים תואמות כדי לחבר את שלושת חלקי הנוקליאוטיד לתווית.