על פי מודל הדחייה האלקטרוני-זוגי של Valence-Shell, שהיה מקובל בקרב כימאים מאז התפתחותו בשנות החמישים, דחייה בין זוגות אלקטרונים מעצבת את המולקולה בצורה שתפחית את האנרגיה הדוחה, או מקסימום המרחק בין הזוגות האלה.
בעקבות טיוטה של מבנה הנקודות לואיס של מולקולה, המשתמשת בנקודות לזיהוי מספר הערכיות, או הקליפה החיצונית, אלקטרונים שיש לכל אטום כלול, לאחר מכן תוכלו לספור את מספר קבוצות האלקטרונים המקשרות ולא מקשרות המקיפות את אטום מרכזי. זוגות אלה מרווחים סביב מעטפת הערכיות באופן שישיג את המרחק הרחוק ביותר שניתן אותם, אך רק צמדי האלקטרונים המקשרים, או אלה המחוברים לאטום, יתרמו לגמר המולקולה צוּרָה.
מולקולה עם שני זוגות אלקטרונים מקשרים וללא זוגות שאינם קשורים, כמו פחמן דו חמצני, תהיה ליניארית. בעוד שהמולקולות של מים ואמוניה מכילות ארבע קבוצות אלקטרונים של קליפות ערכיות, מולקולת המים מכילה שני קשרים ושני שאינם קשורים זוגות אלקטרונים, וכתוצאה מכך מולקולה בצורת V, כאשר שני אטומי המימן נאלצים להתקרב זה לזה כדי להסביר את שני הזוגות שאינם קשורים אלקטרונים. מולקולת האמוניה כוללת, עם זאת, שלושה זוגות אלקטרונים מקשרים, אחד לכל אטום מימן, וכך נוצרת צורת פירמידה טריגונאלית.