La vita è fiorita nelle foreste pluviali e negli ambienti marini del Costa Rica (una su 20 di tutte le specie vegetali e animali si trova in Costa Rica), ma ci sono anche oltre 100 specie in pericolo di estinzione dell'Unione internazionale per la conservazione della natura e delle risorse naturali elenco. La deforestazione, la conversione dell'habitat e l'inquinamento sono i colpevoli dell'attenuazione di molte specie.
Mammiferi
La Costa Rica ha una delle popolazioni di pipistrelli più ricche al mondo, composta da metà della popolazione di mammiferi. Le specie di pipistrelli nell'elenco vanno dal grande pipistrello spettrale predatore al pipistrello bianco dell'Honduras, di soli 37-47 mm di lunghezza, sebbene entrambi siano a basso rischio. Felini come il gattino maculato, il puma costaricano e il giaguaro centroamericano sono stati cacciati dal loro habitat e tamarini cottontop, urlatrici ammantate e primati scimmia ragno di Geoffroy sono stati notevolmente ridotti. Altri mammiferi minacciati includono il formichiere gigante, il cervo Sambar e il tapiro di Baird.
Uccelli
La Costa Rica ospita 894 specie di uccelli, più che negli Stati Uniti e in Canada messi insieme. Di questi, oltre 600 sono residenti permanenti, tra cui l'uccello ombrello dal collo nudo minacciato, il guan nero e il tanager blu e oro, ma uccelli come la cerulea e la sterna elegante sono migratori. Il fringuello dell'isola di Cocos risiede sull'isola di Cocos a 360 miglia al largo della costa del Costa Rica. È l'unico dei fringuelli di Darwin non completamente endemico delle Galápagos. Altri uccelli minacciati includono specie familiari come l'aquila (aquila nera solitaria), l'ara (grande ara verde), il colibrì (colibrì di mangrovie) e il pappagallo (pappagallo dalla fronte rossa).
Rettili e Anfibi
L'iguana dalla coda spinosa a cinque chiglie e la tartaruga di fango dai ponti stretti sono alcuni dei rettili a rischio di estinzione, ma ce ne sono molti altri anfibi minacciati, la maggior parte dei quali sono rane o salamandre che sono tipicamente rappresentati da una grande diversità nella foresta pluviale ambienti. La rana foglia di lemure e la raganella di Starrett sono elencate come in pericolo di estinzione. Così sono la salamandra verme El Empalme e due specie di rospi: il rospo pico blanco e il rospo passerino. Il rospo dorato di Monte Verde non si vede dal 1989 ed è considerato estinto.
Pesce
La maggior parte dei pesci costaricani nell'elenco delle specie in via di estinzione sono quasi minacciati o vulnerabili. Questi includono la cernia olivastra, il cavalluccio marino del Pacifico e lo squalo corona. Nella lista sono presenti anche un certo numero di raggi, come il raggio elettrico bullseye nel Pacifico e il raggio cownose nell'Atlantico.
invertebrati
Ci sono un certo numero di damigelle d'ombra in via di estinzione, insetti che sembrano simili alle libellule. Questi includono specie dal dorso nero, allungate, chiriquita, cacao e reventazon. Molti degli altri insetti in via di estinzione sono libellule dalla coda come il limon, la gobba, il catago, il vulcano, l'alajuela e le specie cornute. Anche due specie di granchi d'acqua dolce e diversi coralli marini sono stati inseriti nell'elenco IUCN.
Impianti
Ci sono oltre 9.000 specie conosciute di piante in Costa Rica. Le piante in via di estinzione includono membri della famiglia delle leguminose come l'abarema e il lancepod, quest'ultimo deriva il suo nome dal suo frutto a forma di lancia. Ci sono anche 24 specie della pianta da fiore eugenia, nove specie della pianta aromatica quararibea e due specie del genere virola, che è strettamente imparentata con la noce moscata e presenta fiori gialli con un pungente odore. Altri principali generi minacciati includono il coralberry, la palma a ventaglio cryosophila e l'albero deciduo sempreverde o della stagione secca cedrela. La jatropha costaricana, l'albero di manilkara e l'albero di gavilán blanco sono specie di piante specificamente minacciate.
