Come calcolare Audpc

L'Area Under the Disease Progress Curve (AUDPC) è una misura quantitativa dell'intensità della malattia nel tempo. Viene utilizzato in fitopatologia per indicare e confrontare i livelli di resistenza alle malattie tra varietà di piante. Il metodo del trapezio.è il modo più comune per calcolare AUDPC. Viene eseguita utilizzando una formula ideata da Campbell e Madden nel 1990 o tracciando un grafico della percentuale di infezione nel tempo e sommando i trapezi tra gli intervalli di tempo.

Regole di ricerca e linee guida che si applicano alla misurazione della malattia specifica e della coltura su cui si indaga. La dimensione richiesta del campione di piante varia a seconda della coltura e della malattia. Lo studio della peronospora nei tuberi, ad esempio, richiede un campione minimo di 40 piante.

Guarda attentamente i segni della malattia. Ricerca quando si prevede che si manifestino i segni in modo da essere preparati. Ad esempio, i segni di peronospora si verificano circa 30-40 giorni dopo la semina e 10 giorni dopo l'ultima applicazione di fungicida.

Registrare la percentuale di superficie fogliare infetta a intervalli di tempo regolari. I ricercatori leggono la peronospora ogni sette giorni se la malattia progredisce più rapidamente del previsto. Le letture vengono effettuate ogni 14 giorni quando la progressione della malattia è più lenta.

Interrompere la registrazione delle misurazioni delle infezioni quando la percentuale di infezione smette di aumentare e i livelli di progressione della malattia.

Moltiplicare il valore medio o medio per l'intervallo di tempo, che è il numero di giorni dalla prima lettura alla seconda lettura. Se hai effettuato la prima lettura il giorno 20 e la seconda lettura il giorno 27, ad esempio, il numero di giorni, o intervallo di tempo, è di sette giorni.

Ripeti i passaggi da uno a quattro per la seconda e la terza lettura dell'infezione che hai effettuato. Il loro risultato sarà l'area di un secondo trapezio. Ripetere i passaggi da uno a quattro finché non si calcolano le aree trapezoidali per tutte le letture.

Aggiungi tutti i trapezi per trovare l'AUDPC. AUDPC inferiori rappresentano una progressione della malattia più lenta e una maggiore resistenza alla malattia. AUDPC più alti rappresentano una progressione più rapida della malattia e una maggiore suscettibilità alla malattia.

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