Una centrifuga è un apparato costituito da un compartimento che ruota su un asse centrale. Il movimento rotatorio fa sì che i materiali si separino in base alle loro diverse gravità. Un rotore della centrifuga è l'unità rotante della centrifuga, che ha fori fissi praticati ad angolo. Le provette vengono posizionate all'interno di questi fori e il rotore gira per favorire la separazione dei materiali. Esistono tre tipi di rotori per centrifuga: rotori basculanti, ad angolo fisso e verticali.
Un rotore basculante di solito supporta campioni di volume compreso tra 36 ml e 2,2 ml. Gli swing-bucket possono supportare due tipi di separazioni: rate-zonale e isopicnic. Le benne oscillanti sono preferite per le separazioni rate-zonali, poiché la distanza tra l'esterno del menisco e l'esterno del fondo del tubo è sufficientemente lunga da consentire la separazione.
I rotori ad angolo fisso vengono solitamente utilizzati per applicazioni di pellettizzazione per raccogliere particelle di pellet da una sospensione e rimuovere i detriti in eccesso o per raccogliere il pellet. Le cavità del rotore vanno da 0,2 ml a 1 ml. L'aspetto più importante nella decisione di utilizzare un rotore ad angolo fisso è il fattore K. Il fattore K indica l'efficienza con cui il rotore può pellet alla massima velocità. Più basso è il fattore K, maggiore è l'efficienza di pellettizzazione.
I rotori verticali sono altamente specializzati. Sono tipicamente usati per legare il DNA nel cloruro di cesio. I rotori verticali hanno fattori K molto bassi, il che è utile se la particella deve spostarsi solo per una breve distanza fino a quando non si agglomera. Il tempo di esecuzione sui rotori verticali è breve.