Setelah Anda menjalankan sampel DNA pada gel agarosa dan mengambil gambar, Anda dapat menyimpan gambar untuk nanti, di mana Anda dapat menganalisis hasilnya dan menafsirkannya. Jenis hal yang Anda cari akan bergantung pada sifat eksperimen Anda. Jika Anda melakukan sidik jari DNA, misalnya, Anda mungkin ingin membandingkan ukuran potongan DNA dari dua sampel -- dari tersangka dan dari sampel TKP, mungkin. Jika Anda bekerja dengan plasmid dari bakteri, sebaliknya, Anda mungkin perlu memastikan plasmid berisi sisipan. Akibatnya, bagaimana Anda menginterpretasikan gel Anda sebagian akan bergantung pada eksperimen yang Anda lakukan. Meskipun demikian, ada beberapa aturan umum yang dapat Anda terapkan.
Perhatikan bahwa Anda mungkin perlu atau tidak perlu menggunakan petunjuk di bagian ini. Elektroforesis gel agarosa sering digunakan untuk mengkonfirmasi bahwa plasmid mengandung sisipan tertentu. Jika Anda tidak bekerja dengan plasmid, Anda dapat melewati bagian ini. Namun, jika ya, Anda dapat mengikuti petunjuk ini.
Perhatikan bahwa jika Anda bekerja dengan plasmid yang tidak dipotong atau dipotong, Anda tidak dapat memperkirakan ukurannya menggunakan prosedur dari bagian 1 di atas. Itu karena plasmid yang tidak terpotong dan terpotong bermigrasi dengan kecepatan yang berbeda dari DNA linier.
Bandingkan jumlah band di setiap jalur. Ingatlah bahwa enzim restriksi memotong DNA di tempat di mana urutan tertentu yang disebut situs restriksi terjadi. Jika sampel diperlakukan dengan DUA enzim restriksi, pita untuk sisipan dan pita untuk sisa plasmid harus ada. Itu karena sisipan akan diapit oleh dua situs restriksi, masing-masing untuk enzim yang berbeda, sehingga pemotongan di kedua situs ini akan membebaskan sisipan dari plasmid. Pemotongan hanya pada satu tempat, sebaliknya, akan mengubah plasmid menjadi DNA linier. Potongan sampel tanpa enzim restriksi atau satu enzim restriksi harus memiliki satu pita, sedangkan sampel yang dipotong dengan dua enzim restriksi harus memiliki dua pita.
Carilah pita yang dibuat oleh DNA plasmid yang terpotong. Plasmid yang terpotong memiliki potongan hanya pada satu untai, sehingga bermigrasi lebih lambat daripada plasmid yang terpotong. Plasmid yang dipotong pada gilirannya bermigrasi lebih lambat daripada DNA yang tidak dipotong.
Perkirakan ukuran sisipan menggunakan prosedur yang dijelaskan di Bagian 1 dan tentukan apakah itu sesuai dengan harapan Anda (yang akan bervariasi tergantung pada eksperimen.)
Hal yang Anda Butuhkan
- Pensil
- Kertas
- Program lembar bentang
- Gambar gel Anda
- Penggaris