Dua kerajaan prokariotik adalah Eubacteria dan Archaea. Prokariota adalah organisme bersel tunggal yang relatif sederhana; organisme yang lebih kompleks (termasuk semua organisme bersel banyak) adalah eukariota. Sebelumnya, hanya ada satu kerajaan prokariota, yang dikenal sebagai Monera. Namun, ketika para ilmuwan menemukan bentuk kehidupan baru dan lebih aneh, sebuah kerajaan baru harus diciptakan.
Karakteristik Prokariota
Dibandingkan dengan eukariota, prokariota adalah organisme bersel tunggal yang relatif sederhana. Prokariota hanya memiliki sebagian kecil dari jumlah DNA sebagai eukariota, dan mereka tidak memiliki organel yang lebih kompleks seperti mitokondria. Yang penting, DNA prokariota tidak terkandung dalam nukleus (yang merupakan perbedaan utama antara prokariota dan eukariota), melainkan mengambang bebas di dalam sel. Prokariota dapat terlibat dalam reproduksi seksual atau aseksual, dan beberapa memiliki organel kloroplas, yang memungkinkan mereka membuat makanan sendiri melalui proses fotosintesis.
Eubacteria
Kerajaan Eubacteria adalah kerajaan prokariotik yang telah dikenal selama lebih dari seratus tahun, terutama karena ini adalah bakteri yang menyebabkan penyakit pada manusia (juga dikenal sebagai patogen). Ada ribuan spesies eubacteria yang diketahui, meskipun mereka umumnya dibagi lagi berdasarkan bentuknya: batang, spiral, dan bulat. Eubacteria penting bagi ekosistem global karena mereka memecah bahan organik mati menjadi nitrogen, yang kemudian dikembalikan ke atmosfer dan digunakan untuk menyuburkan tanaman.
Archaea
Kerajaan Archaea adalah kerajaan prokariotik yang relatif baru, dan organismenya berbeda dari eubacteria karena lingkungan tempat mereka tinggal. Archaea berbeda dari hampir semua bentuk kehidupan lain karena mereka dapat bertahan hidup di lingkungan yang ekstrim, seperti di dasar ventilasi laut atau di air asam. Seperti eubacteria, ada berbagai macam spesies Archaea, dengan beberapa kemampuan yang tidak ditemukan di mana pun organisme lain, seperti Halobacterium, yang menggunakan air garam untuk menggerakkan pompa proton yang memberinya energi.
Virus
Terlepas dari kesamaan mereka dengan eubacteria dan Archaea, virus tidak dianggap organisme prokariotik, dan dengan demikian mereka tidak memiliki kerajaan sendiri. Meskipun mereka memiliki informasi genetik yang dikodekan dalam DNA seperti prokariota, virus tidak memiliki organel lain, juga tidak berperilaku seperti prokariota. Virus harus menempel pada sel organisme lain untuk bereproduksi; kurangnya sarana reproduksi independen ini merupakan alasan penting mengapa virus tidak diklasifikasikan sebagai organisme.