DNA memiliki banyak jalur perbaikan. Satu harus terjadi dalam terang, dan beberapa dapat terjadi dalam gelap. Mekanisme ini dibedakan berdasarkan apakah enzim yang diperlukan untuk melakukan tindakan tersebut memperoleh energinya dari matahari.
Dua basa DNA dapat menjadi ikatan silang dengan adanya sinar UV. Tautan silang ini mencegah berbagai proses seluler terjadi, termasuk replikasi DNA.
Dalam perbaikan ringan, enzim yang disebut fotoliase memotong DNA yang terkait-silang yang disebabkan oleh kerusakan UV. Fotoliase membutuhkan energi matahari.
Reaksi gelap menggunakan enzim yang disebut N-glikosilase untuk memotong ikatan silang dalam DNA. Secara khusus, N-glikosilase tidak membutuhkan energi dari matahari.
Perbaikan rekombinasi juga merupakan mekanisme perbaikan DNA yang tidak memerlukan cahaya. Mesin replikasi DNA tidak dapat mereplikasi melintasi basis DNA yang terhubung silang. Namun, itu bisa melompat, meninggalkan celah. Kesenjangan ini dapat diisi oleh kromosom yang berlawanan setelah replikasi, tetapi sebelum pembelahan sel terjadi. Proses ini dikenal sebagai rekombinasi homolog dan tidak memerlukan cahaya.
Perbaikan eksisi terjadi ketika pasangan basa ikatan silang dikenali oleh kompleks protein yang menghilangkan beberapa basa yang membentang sebelum dan sesudah ikatan silang. Setelah pemindahan, DNA direplikasi dengan benar menggunakan untai yang tidak terdistorsi sebagai cetakan.
