Centrifuge adalah alat yang terdiri dari kompartemen yang berputar pada sumbu pusat. Gerakan berputar menyebabkan material terpisah berdasarkan gravitasinya yang berbeda. Sebuah rotor centrifuge adalah unit berputar dari centrifuge, yang memiliki lubang tetap dibor pada suatu sudut. Tabung reaksi ditempatkan di dalam lubang ini dan rotor berputar untuk membantu pemisahan bahan. Ada tiga jenis rotor centrifuge: swing-bucket, fixed-angle dan rotor vertikal.
Sebuah rotor swing-bucket biasanya mendukung sampel mulai dari volume 36 mL hingga 2,2 mL. Swing-bucket dapat mendukung dua jenis pemisahan: rate-zonal dan isopycnic. Swing-bucket lebih disukai untuk pemisahan rate-zonal, karena jarak antara bagian luar meniskus dan bagian luar dasar tabung cukup panjang untuk terjadi pemisahan.
Rotor sudut tetap biasanya digunakan untuk aplikasi pelet baik partikel pelet dari suspensi dan menghilangkan sisa kotoran, atau untuk mengumpulkan pelet. Rotor rongga berkisar dari 0,2 mL sampai 1 mL. Aspek terpenting dalam memutuskan untuk menggunakan rotor sudut tetap adalah faktor K. Faktor K menunjukkan seberapa efisien rotor dapat menghasilkan pelet pada kecepatan maksimum. Semakin rendah faktor K, semakin tinggi efisiensi pelet.
Rotor vertikal sangat terspesialisasi. Mereka biasanya digunakan untuk mengikat DNA dalam cesium klorida. Rotor vertikal memiliki faktor K yang sangat rendah, yang berguna jika partikel hanya bergerak dalam jarak pendek sampai menjadi pelet. Waktu pengoperasian pada rotor vertikal pendek.