A tudósok képesek szekvenálni a DNS-molekulát; más szavakkal, meg tudják határozni a nukleotidbázisok sorrendjét bármely adott molekulában. A DNS-molekula szekvenálása lehet az első lépés a szükséges lépések számának meghatározásához egy DNS-molekula nukleotidjai kölcsönhatásba lépnek egymással, és kódolják az an szervezet. A DNS-szekvenálás folyamata inkább érintett, de az automatikus DNS-szekvenátorok minimálisra csökkentik a szükséges emberi részvételt, legalábbis a folyamat egy részében.
Minta előkészítés
Az automatikus DNS-szekvenátor működéséhez meg kell detektálnia a DNS-t alkotó négy nukleotid-bázist: adenint, guanint, timint és citozint. A tudósok sokszor lemásolnak egy DNS-darabot, és restrikciós enzimek segítségével különböző méretű darabokra vágják a DNS-t. Ezután kis mennyiségű fluoreszcensen jelzett bázist adnak minden egyes DNS-tételhez. A bázis, amely akár adenin, timin, guanin vagy citozin, a szál végén kötődik báziskomplimentjéhez. Például az adenin kötődik a timinnel végződő szálakhoz, a guanin pedig a citozinnal végződő szálakhoz.
Automatikus DNS-szekvenciás felépítés
Az automatikus DNS-szekvenszer hasonlóan épül fel, mint egy DNS-szekvenszer, amely több kézi munkát igényel. Pontosabban, az automatikus DNS-szekvenátor egy körülbelül 1 láb hosszú tartály, 96 géllyukkal, amelyekbe DNS önthető. Egy automatikus DNS-szekvenátorban, akárcsak bármely más DNS-szekvenátorban, a DNS-t a tartály tetején lévő géllyukakba injektálják, és negatív töltetet alkalmaznak a tartály ezen végére. A negatív töltés erős lendületet ad a DNS-szálaknak, hogy különböző távolságokat haladjanak a tartály végéig.
Automatikus befecskendezés
Egy automatikus DNS-szekvenszer automatikusan adagolja a DNS-tételeket a gél tetejébe. Mint ilyen, óriási időt és erőfeszítést takarít meg a kutatók számára. A tételek beadása után a szekvenszer automatikusan negatív töltetet tölt be a tartály egyik végére, aminek következtében a szálak változó távolságban vándorolnak a gélen keresztül. A különböző távolságok a gélen áthaladó különböző DNS-szálak méretét tükrözik.
Detektor
Számos automatikus DNS-szekvenáló gép van felállítva a fluoreszcens festék kimutatására a gélen áthaladó DNS-szálakon. Ennek során azonosíthatják a szálak végén lévő nukleotidokat, és rögzíthetik őket a számítógépen. A szekvenátorok azonban a legjobb esetben a DNS nukleotidok összekevert változatát mutatják be. Az automatikus DNS-szekvenáló gép használata után át kell esnie egy "befejezés" nevű folyamaton, amelyben számítógépek kombinációja történik és a kutatók a DNS-szál detektálásának eredményeit válogatják össze, hogy az adatokat egy DNS átfogó leírásává állítsák össze part. Nem meglepő, hogy ez a folyamat sokkal tovább tarthat, mint a szekvenálás tényleges folyamata.