A két prokarióta királyság az Eubacteria és az Archaea. A prokarióta egy viszonylag egyszerű egysejtű szervezet; a bonyolultabb organizmusok (beleértve az összes többsejtű szervezetet) eukarióták. Korábban egyetlen prokarióták királysága volt, Monera néven. Mivel azonban a tudósok új és furcsább életformákat fedeztek fel, új királyságot kellett létrehozni.
Prokarióta jellemzői
Az eukariótákhoz képest a prokarióták viszonylag egyszerű, egysejtű szervezetek. A prokariótáknak csak töredéke van a DNS mennyiségéből, mint eukariótákból, és hiányoznak bonyolultabb organellák, például mitokondrium. Fontos, hogy a prokarióta DNS-e nem található a magban (ez a fő különbség a prokarióták és az eukarióták között), hanem szabadon lebeg a sejtben. A prokarióták nemi vagy ivartalan szaporodásban vehetnek részt, és némelyikük kloroplaszt szerves sejtekkel rendelkezik, amelyek lehetővé teszik számukra, hogy saját ételt készítsenek a fotoszintézis során.
Eubacteriumok
Az Eubacteria Királyság több mint száz éve ismert prokarióta királyság, elsősorban azért, mert ezek azok a baktériumok, amelyek emberben betegségeket okoznak (más néven a kórokozó). Több ezer ismert eubaktériumfaj létezik, bár általában alakjaik szerint fel vannak osztva: rúd, spirál és gömb. Az eubaktériumok azért fontosak a globális ökoszisztéma számára, mert az elhalt szerves anyagokat nitrogéngé bontják, amelyet aztán visszavezetnek a légkörbe és felhasználnak a növények trágyázására.
Archaea
Az Archaea Királyság egy viszonylag új prokarióta királyság, élőlényei az élő környezetük miatt különböznek az eubaktériumtól. Az archeák szinte minden más életformától különböznek, mert extrém körülmények között képesek fennmaradni, például a tengeri szellőzőnyílások fenekén vagy savas vízben. Az eubacteriumokhoz hasonlóan az Archaea fajok sokfélesége létezik, némelyik olyan képességekkel rendelkezik, amelyek egyikben sem találhatók meg más organizmusok, például a Halobacterium, amely sós vizet használ az energiát adó protonpumpa működéséhez.
Vírusok
Az eubaktériumokhoz és az Archaea-hoz való hasonlóságuk ellenére a vírusok nem tekinthetők prokarióta organizmusoknak, és ezért nincs saját királyságuk. Míg genetikailag rendelkeznek olyan DNS-sel kódolva, mint a prokarióták, a vírusok nem rendelkeznek más organellumokkal, és nem is viselkednek úgy, mint prokarióták. A vírusoknak szaporodniuk kell más organizmusok sejtjeihez; a szaporodás független eszközének hiánya fontos oka annak, hogy a vírusokat nem sorolják be organizmusnak.