A növények, az algák és a különféle fitoplankton sejtjeiben klorofillt tartalmaz. A sejtek molekuláris összetételének ez a létfontosságú része irányítja a szervezetben vagy a növényben a fotoszintézis folyamatát. A kutatók gyakran tesztelik a klorofillszintet a tavakból, folyókból és patakokból származó felszíni vizek mintáiban, valamint a növények életében. A vizsgálati eredmények jelzik a mintát befolyásoló jelenlegi állapotokat és tápanyagszinteket.
A klorofill szintjének mérése segít meghatározni egy szervezet állapotát és a víz minőségét. A magas klorofillszint általában azt jelzi, hogy a mintában sok tápanyag van, általában nitrogén és foszfor. A szokatlanul alacsony klorofillszint a szennyezést, a szeptikus rendszer szivárgását vagy lefolyását jelzi a területen. Általában a mintákat összegyűjtik és idővel összehasonlítják a mintaterület változásainak nyomon követésére.
A spektrofotometria és a nagy teljesítményű folyadékkromatográfia (HPLC) két módszer a vízmintában lévő klorofill mennyiségének mérésére. A vizet összegyűjtjük és szűrjük, hogy izoláljuk a klorofillt tartalmazó organizmusokat. Ezen organizmusok sejtjei felszakadnak a klorofill kivonására. Az összegyűjtött mintát acetonos oldatba helyezzük. A mintát spektrofotometriával vagy HPLC módszerrel elemezzük. A spektrofotometria magában foglalja a klorofill abszorpciós vagy fluoreszcens tulajdonságainak vizsgálatát. A minta elemezhető HPLC módszerrel is. A két laboratóriumi vizsgálati módszer a minta fluoreszkáló képességeinek mérését jelenti. A mintákat egy bizonyos hullámhosszú fénynek teszik ki (általában 663 és 645 nm), ami a klorofill reakcióját teszi lehetővé nagyobb hullámhossz kibocsátásával.
Mérővel tesztelheti a klorofillszintet, általában az élő növényeket. Két LED világít a minta felületén, valószínűleg növényi levél. A piros LED fény csúcshullámhossza 650 nm, az infravörös LED csúcsa 940 nm. A fény egy részét elnyeli a klorofill; a többi a minta egészében felszívódik. A klorofillnak a minta egyéb mértékeihez viszonyított arányát a számlálón belül kell kiszámítani, és tetszőleges egységként jelenik meg 0 és 199 között.