A HPLC (nagy teljesítményű folyadékkromatográfia) és a GC (gázkromatográfia) egyaránt tudós - a minták elemzésére, hogy meghatározzuk, mit tartalmaz a minta, vagy a molekulák koncentrációja a minta. Mindkettő ugyanazt az elvet alkalmazza, hogy a nehezebb molekulák lassabban eluálódnak vagy áramlanak, mint a könnyebbek (a polaritás is szerepet játszik az elúciós időben). Bár az ötlet ugyanaz, a GC és a HPLC számos különbséggel rendelkezik.
A mobil fázis
A kromatográfiai berendezés mozgó fázisa az az anyag, amely a mintát a gépen keresztül mozgatja. A HPLC-ben a mozgófázis szerves oldószerből, ultratiszta vízből és egyéb összetevőkből álló folyadék, amely biztosítja a mintával való kompatibilitást. A GC a mobil fázisához gázt használ. Az alkalmazott gázok közé tartozik a hélium, a nitrogén, az argon vagy a hidrogén, attól függően, hogy mit elemeznek.
Az oszlopok
Ahogy a minták kromatográfiás oszlopokon haladnak, a minta és a mozgófázis kölcsönhatásba lépnek az oszlop tartalmával, ami a minta komponenseinek különböző időpontokban eluálódását okozza. A HPLC oszlopok általában négy-hat hüvelyk hosszú fém- vagy üvegcsövek, szorosan szilícium-dioxiddal vagy különböző szénlánc-hosszúsággal csomagolva. A GC rendszerek tekercselt kapilláris oszlopokat tartalmaznak, belső falakkal, amelyek a laboratóriumi igényektől függően különböző anyagokkal vannak bevonva. A kinyújtott GC oszlopok elérhetik a 100 láb hosszúságot.
A minták
A GC-t illékony vegyületekhez (azokhoz, amelyek gyorsan lebomlanak) használnak, míg a HPLC jobb a kevésbé illékony minták esetében. Ha egy minta sókat tartalmaz vagy töltést hordoz, akkor HPLC-vel kell elemezni, nem pedig GC-vel.
Hőmérséklet-szabályozás
A GC oszlopokat egy sütőben helyezik el a gépen belül. A minták elemzése közben a számítógép megváltoztatja a hőmérsékletet. Minél magasabb a hőmérséklet, annál gyorsabban eluálódik a minta, de a túl magas hőmérséklet gyenge eredményeket produkál. A HPLC oszlopokat állandó hőmérsékleten (leggyakrabban szobahőmérsékleten) tartjuk.