A kövületeket két fő módon őrizzük meg: változtatással és anélkül. A változtatással történő megőrzés magában foglalja a karbonizálást, a megkövesedést, az átkristályosítást és a helyettesítést. A változtatás nélküli megőrzés magában foglalja a formák használatát és a közvetett bizonyítékok gyűjtését.
Szénsavasodás
A karbonizáció gyakran előfordul a növények és a lágy organizmusok megőrzésében. A növény vagy állat maradványait a kőzet súlya alatt összezúzzák. A gázokat, beleértve a hidrogént, a nitrogént és az oxigént, a hő és a sűrítés folyamán gázosítják. Ami hátrahagyott, az egy szénfólia, az egykori élőlény benyomása.
Kövület
Néha permineralizációnak nevezik, a megkövesedés akkor következik be, amikor egy porózus anyag, például egy csont vagy héj megmarad konzerváló anyagokkal, például kalcium-karbonáttal vagy szilícium-dioxiddal. Az eredeti héj vagy csont a föld alá temetkezik, és a víz behatol a felszínre. A talajvíz tartalmazza az anyag üres tereit kitöltő kalcium-karbonátot, amely idővel megkeményíti és tele tölti a pórusokat ásványi anyagokkal, amelyek megőrzik az anyagot.
Átkristályosítás
Az átkristályosodás gyakran a héjas kövületekben történik, és ez az a folyamat, amelynek során a kis molekula kristályosodik a héj belsejében, amely gyakran egyfajta kalcium-karbonátból áll, átalakulhat egy másik típusú kalciumsá karbonát. Ez stabilizálja a héjat és fosszíliává változtatja.
Csere
A kagylókban és a fában egyaránt előfordul a helyettesítés, amikor az eredeti élőlény atomösszetételét sejtekről sejtekre cserélik egy új kémiai szerkezet. Az eredetit helyettesítő vegyi anyagot általában a talajvíz határozza meg, amelyben a kövület fekszik. A helyettesítés általános típusa a szilikát. Ekkor az eredeti élő maradványokat szilícium-dioxiddal helyettesítik, mint a megkövesedett erdők esetében.
Öntvény
Az öntés és az öntés a kövületek megőrzésének közvetett módja. Ebben az esetben a közvetett azt jelenti, hogy a szerves anyag kémiai összetétele nem változik, sokkal inkább egy olyan anyagban rejlik, amely benyomást tesz az anyagra. Gyakori példák a páfránylevél és a csigahéj öntése.
Nyomkövető kövületek
Nyomkövető kövületek a kövületek közvetett megőrzésének másik típusa. A nyomkövető kövületek például a lábnyomok és a nyomvonalak. A dinoszauruszok és más őskori állatok áthaladtak az aljnövényzeten és a talaj mentén, amelyet később más törmelék borított. Bizonyos esetekben a nyomukat megőrizték, és ki lehet ásni és kivágni a földből. A nyomkövető kövület másik példája az állati trágya. A megőrzött, megkövesedett trágya a fosszilis szakemberek számára bizonyítékokat szolgáltat az ősi táplálékforrásokról és az őskori emésztőrendszer felépítéséről.