A korallzátonyok a korallok exoskeletonjai által alkotott meszesített tengeri struktúrák és a három fő növényfaj A korallzátonyokkal kölcsönhatásban lévő algák, tengeri fű és mangrove, az algákat vörösre és zöldre osztva fajták. Ezen tengeri növények közül sok a korallzátonyoknak kedvez. A korallzátonyok ökoszisztémái szintén sokféle állatvilágot tartalmaznak, és a Föld legélénkebb ökoszisztémái közé tartoznak.
Vörös algák és korallzátonyok
A korallzátonyoknak nevezett vörös algák egy bizonyos típusának nagy szerepe lehet a korallzátony stabilitásának fokozásában. A coralline-algák védőkalciumot raknak le a sejtfalakba, és ezek az inkrustálódott algák különböző korallokat cementálnak össze, javítva a zátony szerkezetét. A geniculate corallines inkrustált faszerű szerkezettel rendelkezik, amely némileg rugalmas, néhány kalcium nélküli terület jelenléte miatt. A nongeniculate corallines lassan növekvő kéreg, amely a korallokon kívül a sziklákra, a kagylókra, más algákra és a tengeri füvekre is ragaszkodhat.
Zöldalga és korallzátonyok
A zöld algák a tengeri növények másik csoportját alkotják, amelyek alkalmazkodtak a korallzátonyokon való túléléshez. Valójában a korallzöld algák bizonyos területeken annyira sikeresek, hogy valójában veszélyt jelentenek gazdáikra. Amikor a korallzátony és a zöldalgák viszonya egyensúlyban van, az algák a zátonyon nőnek, és táplálékot szolgáltatnak a legelésző halak számára. Amikor azonban nagy mennyiségű tápanyag érkezik part menti szennyvíz formájában, az algaközösség feltöltődik, felrobban méretű, és következésképpen csökkenti a korallok számára hasznos baktériumok jelenlétét, miközben elősegíti a káros szaporodását baktériumok.
Tengeri füvek és korallzátonyok
A korallzátonyokkal és a mangrove-okkal folytatott fontos ökológiai háromirányú kölcsönhatás részeként a tengeri füvek hajlamosak a part menti élőhelyeken virágozni. A korallzátonyok által az óceán hullámaitól védett vizek lehetővé teszik, hogy a tengeri fű gyökeret eresszen, cserébe a tengeri fű lassan le és csapdába ülteti az üledékeket, megakadályozva, hogy az üledék terhelése a vízben túl magas legyen a korallok számára túlélni. A tengeri füves rétek többféle fajt tartalmazhatnak, és csak olyan mélységig jutnak el, amelyet a fotoszintézis igényei megengednek.
Mangrove és korallzátony
A tengeri füvekhez hasonlóan a mangrove is virágzik a korallzátonyok által kínált erőszakos óceánhullámok elleni védelem eredményeként. A mangrove elsősorban a tengeri fűnek és a korallzátonyoknak kedvez elsősorban a parti erózió enyhítésével és ezáltal a káros üledékmennyiségek parti vizekbe jutásának megakadályozásával. A mangrove-erdők pufferzónaként működnek a szennyezés lefolyása, különösen a tápanyagokban gazdag szennyvíz esetében is, amelyek megzavarhatják a korallzátony – tengeri füves rét – mangrove erdei rendszer ökológiai egyensúlyát. A mangrove tengeri gyökerei számos part menti halfaj kritikus faiskolájaként is működnek.