Massachusetts őshonos emlősei ugyanolyan változatosak, mint e gyönyörű állam domborzata az Egyesült Államok északkeleti részén. 2009 februárjától a Massachusettsi Halászati és Vadvédelmi Osztály kijelenti, hogy az államban potenciálisan 60 őshonos emlős volt jelen. Ez a szám nem tartalmazza azokat a tucatnyi további fajt, amelyek csavargók, vagy amelyeket Massachusetts-be vezettek be. Az államban őshonos emlősök mind placentán vannak, és általában kedvelt szárazföldi vagy tengeri élőhelyeik szerint osztályozhatók.
Erdei emlősök
A Massachusetts-i erdők vegyes erdőkből állnak, amelyek főleg tűlevelű vagy lombhullató fákkal rendelkeznek. Az őshonos emlősök közül, akik gyakran részesítik előnyben a tűlevelű régiókat, a vörös és a repülő mókusok, a hótalpas nyulak, a jávorszarvasok és a halászok találhatók. A lombhullató területeken gyakran észlelnek oposszumokat, szürke mókusokat, mókusokat, szarvas egereket, vörös és szürke rókákat, fehérfarkú szarvasokat, sertéshúst és számos denevérfajt. A prérifarkasok a bokros cserjés helyeket kedvelik. A fekete medvék gyakori a tűlevelű és a lombhullató élőhelyeket. Míg az emberek félnek tőlük, általában nem támadják meg az embereket, hanem inkább az erdőbe menekülnek.
Füves emlősök
A massachusettsi gyepterületek közé szántók, rétek és termőföldek tartoznak. Az őshonos emlősök, akik a gyepes élőhelyeket részesítik előnyben, közé tartoznak az anyajegyek, a koponyák, a nyúl nyúlai, a pocok és az erdei bak. A füves területeket kedvelő őshonos emlősök gyakran megjelennek a pázsiton és a külvárosi házak hátsó udvarain, és általában kártevőknek számítanak. A Cottontails száma csökken, mivel az államban csökken a kedvelt élőhelyük, például a termőföld és a legelő.
Vizes emlősök
Mocsarak, mocsarak, dagályos partok, nedves rétek és mocsarak jellemzik Massachusetts vizes területeit. Az egész államban vannak vizes területek. Néhány őshonos emlős, amely kedvelt élőhelyei között vizes élőhelyeket is tartalmaz, a pézsmapatkányok, a hermelinfélék, a csibék, az ugró egerek, a lemmingek és a bobcatsok. Egyéb élőhelyek mellett a lemmingek gyakran az áfonya lápokat részesítik előnyben. A Bobcats erdős és cserjés területeken, valamint mocsaras terepen barangol a mezők közelében. Ők az egyetlen vadmacska, amely jelenleg Massachusetts-ben található, és nagyon félénk és megfoghatatlan.
Folyó, tavacska és tó emlősök
Massachusettsben számos, minden méretű folyó, tavacska és tó található. Az őshonos emlősök, akik ezeket az élőhelyeket élvezik a legjobban, többek között a minket, a folyami vidrát és a hódot. A menyétek gyakran különféle élőhelyeket keresnek, de inkább a víz közelében vannak. A folyami vidrák főként a víz közelében találhatók, de néha messze vándorolnak erdős helyekre. A hódok több bejárattal rendelkező gátakat és páholyokat építenek az édesvízi területeken, például tavakban, folyókban és tavakban.
Tengeri emlősök
A Massachusetts atlanti partvidékén számos kikötő és öböl található. Az őshonos emlősök között ezeken a vizeken feketefókák, delfinek és számos delfinfaj található. A Massachusetts partjainál lévő külső kikötőkben és az Atlanti-óceán parti vizein számos bálnafaj létezik, köztük gyilkos, beluga és kísérleti bálna. Az ezeken a vizeken látható veszélyeztetett bálnák a púpos, uszonyos, spermiumok és az északi jobb bálnák.