Na Zemlji sunčeva energija pokreće vjetrove; pa biste na Neptunu, gdje se sunce čini ne većim od zvijezde, očekivali slabe vjetrove. Međutim, vrijedi upravo suprotno. Neptun ima najjače površinske vjetrove u Sunčevom sustavu. Većina energije koja napaja ove vjetrove dolazi sa samog planeta.
U usporedbi s bilo kojim od planeta plinskih divova, Zemljina atmosfera bazen je vedrine. Na Jupiteru vjetrovi u Maloj crvenoj pjegi dosežu 618 kilometara na sat (384 milje na sat), što je gotovo dvostruko brže od vjetrova u najžešćem zemaljskom uraganu. Na Saturnu vjetrovi u gornjim slojevima atmosfere mogu puhati gotovo tri puta jače od toga, brzinom od 1.800 kilometara na sat (1.118 kilometara na sat). Čak i ovi vjetrovi zaostaju za onima blizu Neptunove Velike mračne mrlje, koju su astronomi okrenuli na 1.931 kilometar na sat (1.200 milja na sat).
Poput Jupitera i Saturna, Neptun generira više energije nego što je prima od sunca, a ta energija koja zrači iz jezgre planeta pokreće snažne površinske vjetrove. Jupiter zrači energijom zaostalom od nastanka, a energija koju Saturn zrači velikim je dijelom rezultat trenja proizvedenog helij kišom. Na Neptunu, deka metana - koji je staklenički plin - zarobljava toplinu. Da je planet poput Urana (kojem nedostaje unutarnji izvor energije), ta bi toplina odavno zračila u svemir. Umjesto toga, iako su temperature hladne, planet zrači 2,7 puta više topline nego što je prima od sunca, što je dovoljno za pogon njegovih divljih vjetrova.