Mikrobiologija je proučavanje organizama premalih da bi se mogli gledati bez pomoći. Mikrobiologija se može kategorizirati na mnogo različitih načina, kako i priliči proučavanju organizama koji znatno premašuju višećelijske organizme. Mikrobiologiji se može pristupiti proučavanju različitih taksonomskih podjela ili podijeliti po skupinama proučavanih organizama. Mikrobiologiju također možemo smatrati skupom različitih područja proučavanja ili je možemo podijeliti uzimajući u obzir različite aktivnosti koje mikrobiolozi poduzimaju.
Podjele
Biolozi su sav život na Zemlji razvrstali u jednu od tri ogromne taksonomske skupine nazvane domene: arheje, bakterije i eukarije. Arheje i bakterije su prokarioti, organizmi čije stanice nemaju središnju jezgru. Svi su jednoćelijski organizmi. Bakterije se općenito razlikuju po prepoznatljivoj strukturi u svom vanjskom omotaču - staničnom zidu izgrađenom od molekula zvanih peptidoglikani. Arheje su slične bakterijama, samo što njihova unutarnja biokemija djeluje po drugačijim pravilima, a mnoge od njih prilagođene su teškim uvjetima. Eukaryu karakteriziraju stanice koje u svojim stanicama imaju jezgre i druge jedinstvene unutarnje strukture. Iako su mnogi eukarioti veliki organizmi, poput slonova, drveća sekvoje i ljudi, velika većina eukariotskih vrsta jednostanični su mikroorganizmi.
Grupe
Drugi način razdvajanja proučavanja mikrobiologije su sve skupine jednostaničnih organizama. To zanemaruje taksonomsku razinu organizama i u osnovi smatra da svi entiteti ispod određene veličine potpadaju pod kišobran mikrobiologije. To uključuje bakterije i arheje, koje su domene, i gljive, alge i protozoe, koje su kraljevstva u domeni eukarije. Uključuje i viruse koji nisu u niti jednoj taksonomskoj klasifikaciji živih organizama.
Gljive uključuju plijesni i kvasac. Alge su jednostanične biljke vrste koje površinu ribnjaka pretvaraju u zeleno ili žuto. Praživotinje su poput jednostaničnih životinja - uglavnom su pokretnije od algi ili gljivica. Virusi su potpuno drugačija skupina entiteta koji prelaze granicu između živog i neživog, ali njihova studija također potpada pod kišobran mikrobiologije.
Discipline
Mikrobiologija se također može klasificirati prema disciplinama koje proučavaju mikrobiologiju. Na primjer, imunolozi proučavaju mehanizme nastanka ljudskih bolesti uzrokovanih infekcijom od bakterija, gljivica, virusa ili praživotinja, dok epidemiolozi proučavaju način na koji su infekcije prenose. Prehrambeni i poljoprivredni mikrobiolozi proučavaju način na koji se gljivice ili bakterije mogu koristiti za proizvodnju hrane - zajedno s mehanizmima pomoću kojih mikroorganizmi mogu oštetiti usjeve. Biotehnolozi traže načine kako upotrijebiti mikroorganizme za proizvodnju materijala korisnih čovječanstvu.
Aktivnosti
Mikrobiolozi obavljaju različite aktivnosti tijekom proučavanja mikroskopskih cjelina, a mikrobiologija se također može klasificirati na temelju tih aktivnosti. Oni su prikladno organizirani u skupine koje se nazivaju šest "Ja". Tih šest "Ja" mogu se izraziti kao cijepljenje, inkubacija, izolacija, inspekcija, istraga i identifikacija. Oni se odnose na procese uzgoja, uzorkovanja, promatranja i ispitivanja mikroorganizama.